Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
HMGN3Q15651 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
HMGN3Q15651 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
HMGN3Q15651 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
HMGN3Q15651 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
HMGN3Q15651 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
HMGN3Q15651 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
HMGN3Q15651 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
HMGN3Q15651 AL606834.3-201ENST00000602615 496 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
HMGN3Q15651 RNU4-5P-201ENST00000607255 135 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
HMGN3Q15651 AL354696.1-201ENST00000614652 497 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
HMGN3Q15651 AP000943.4-201ENST00000622912 357 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
HMGN3Q15651 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
HMGN3Q15651 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
HMGN3Q15651 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
HMGN3Q15651 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
HMGN3Q15651 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
HMGN3Q15651 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
HMGN3Q15651 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
HMGN3Q15651 SNORD65C-201ENST00000390962 71 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
HMGN3Q15651 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
HMGN3Q15651 ZNF736P10Y-201ENST00000403990 1110 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
HMGN3Q15651 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
HMGN3Q15651 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
HMGN3Q15651 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC-0.57□□□□□ -2.5
HMGN3Q15651 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
HMGN3Q15651 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC-0.57□□□□□ -2.5
HMGN3Q15651 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
HMGN3Q15651 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
HMGN3Q15651 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
HMGN3Q15651 RNU6-320P-201ENST00000516511 106 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
HMGN3Q15651 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC-0.57□□□□□ -2.5
HMGN3Q15651 AC018554.1-201ENST00000565506 800 ntTSL 2 BASIC-0.57□□□□□ -2.5
HMGN3Q15651 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC-0.57□□□□□ -2.5
HMGN3Q15651 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
HMGN3Q15651 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
HMGN3Q15651 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
HMGN3Q15651 MIR1295B-201ENST00000636144 60 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
HMGN3Q15651 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
HMGN3Q15651 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
HMGN3Q15651 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
HMGN3Q15651 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
HMGN3Q15651 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
HMGN3Q15651 AL365338.1-201ENST00000422282 858 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
HMGN3Q15651 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
HMGN3Q15651 AC114981.1-201ENST00000503897 678 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
HMGN3Q15651 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
HMGN3Q15651 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
HMGN3Q15651 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
HMGN3Q15651 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
HMGN3Q15651 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
HMGN3Q15651 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
HMGN3Q15651 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
HMGN3Q15651 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
HMGN3Q15651 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
HMGN3Q15651 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
HMGN3Q15651 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
HMGN3Q15651 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
HMGN3Q15651 AL135787.1-201ENST00000450154 302 ntTSL 3 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
HMGN3Q15651 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
HMGN3Q15651 RNU6-760P-201ENST00000516078 97 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
HMGN3Q15651 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
HMGN3Q15651 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
HMGN3Q15651 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
HMGN3Q15651 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
HMGN3Q15651 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
HMGN3Q15651 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
HMGN3Q15651 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
HMGN3Q15651 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
HMGN3Q15651 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
HMGN3Q15651 AC132825.7-201ENST00000638744 335 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
HMGN3Q15651 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC-0.59□□□□□ -2.5
HMGN3Q15651 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
HMGN3Q15651 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
HMGN3Q15651 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC-0.6□□□□□ -2.51
HMGN3Q15651 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
HMGN3Q15651 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC-0.6□□□□□ -2.51
HMGN3Q15651 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
HMGN3Q15651 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
HMGN3Q15651 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
HMGN3Q15651 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
HMGN3Q15651 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
HMGN3Q15651 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
HMGN3Q15651 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
HMGN3Q15651 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC-0.6□□□□□ -2.51
HMGN3Q15651 AC107905.1-201ENST00000616204 426 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
HMGN3Q15651 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
HMGN3Q15651 AP000484.1-201ENST00000620067 1252 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
HMGN3Q15651 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC-0.6□□□□□ -2.51
HMGN3Q15651 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
HMGN3Q15651 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
HMGN3Q15651 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
HMGN3Q15651 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
HMGN3Q15651 RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 125 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
HMGN3Q15651 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
HMGN3Q15651 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
HMGN3Q15651 UBE2D3P3-201ENST00000426992 425 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
HMGN3Q15651 AL356361.2-201ENST00000430542 443 ntTSL 3 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
HMGN3Q15651 SNORD4A-201ENST00000459174 72 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
HMGN3Q15651 RNU7-140P-201ENST00000459546 60 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.3 ms