Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SKIV2LQ15477 VWA8P1-201ENST00000510889 176 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SKIV2LQ15477 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SKIV2LQ15477 AC095350.2-201ENST00000544034 201 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SKIV2LQ15477 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SKIV2LQ15477 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SKIV2LQ15477 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SKIV2LQ15477 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
SKIV2LQ15477 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
SKIV2LQ15477 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SKIV2LQ15477 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SKIV2LQ15477 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
SKIV2LQ15477 MAPK10-353ENST00000641803 8483 ntAPPRIS P2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SKIV2LQ15477 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
SKIV2LQ15477 DLG1-217ENST00000452595 3053 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SKIV2LQ15477 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SKIV2LQ15477 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
SKIV2LQ15477 PREPL-207ENST00000409957 4703 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SKIV2LQ15477 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
SKIV2LQ15477 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SKIV2LQ15477 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
SKIV2LQ15477 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
SKIV2LQ15477 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SKIV2LQ15477 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SKIV2LQ15477 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SKIV2LQ15477 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SKIV2LQ15477 RPL35AP15-201ENST00000468042 339 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SKIV2LQ15477 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SKIV2LQ15477 AL592156.1-201ENST00000508758 304 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SKIV2LQ15477 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SKIV2LQ15477 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SKIV2LQ15477 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SKIV2LQ15477 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SKIV2LQ15477 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SKIV2LQ15477 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
SKIV2LQ15477 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SKIV2LQ15477 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SKIV2LQ15477 Z82217.1-201ENST00000625157 8149 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SKIV2LQ15477 R3HDM1-220ENST00000628915 4325 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SKIV2LQ15477 CDH8-205ENST00000577730 8009 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SKIV2LQ15477 KLHL13-208ENST00000541812 3102 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SKIV2LQ15477 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
SKIV2LQ15477 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SKIV2LQ15477 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SKIV2LQ15477 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SKIV2LQ15477 HMGN2P8-201ENST00000391458 268 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SKIV2LQ15477 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SKIV2LQ15477 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SKIV2LQ15477 AC093159.1-201ENST00000416845 424 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SKIV2LQ15477 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SKIV2LQ15477 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SKIV2LQ15477 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SKIV2LQ15477 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SKIV2LQ15477 CRB1-201ENST00000367397 9023 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SKIV2LQ15477 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SKIV2LQ15477 SLAIN2-205ENST00000512093 4219 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SKIV2LQ15477 SYT14-208ENST00000637265 13567 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SKIV2LQ15477 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
SKIV2LQ15477 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
SKIV2LQ15477 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SKIV2LQ15477 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SKIV2LQ15477 RPL23AP46-201ENST00000438548 490 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SKIV2LQ15477 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SKIV2LQ15477 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SKIV2LQ15477 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SKIV2LQ15477 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SKIV2LQ15477 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SKIV2LQ15477 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SKIV2LQ15477 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SKIV2LQ15477 KYNU-201ENST00000264170 15316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
SKIV2LQ15477 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SKIV2LQ15477 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SKIV2LQ15477 FAM169A-203ENST00000510496 5810 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SKIV2LQ15477 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
SKIV2LQ15477 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SKIV2LQ15477 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
SKIV2LQ15477 ADAM28-201ENST00000265769 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
SKIV2LQ15477 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SKIV2LQ15477 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SKIV2LQ15477 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SKIV2LQ15477 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SKIV2LQ15477 MIR921-201ENST00000401133 56 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SKIV2LQ15477 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SKIV2LQ15477 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SKIV2LQ15477 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SKIV2LQ15477 CSRNP3-202ENST00000342316 11684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
SKIV2LQ15477 AP5M1-201ENST00000261558 11737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
SKIV2LQ15477 FANCI-202ENST00000310775 4743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
SKIV2LQ15477 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
SKIV2LQ15477 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
SKIV2LQ15477 G2E3-201ENST00000206595 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
SKIV2LQ15477 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
SKIV2LQ15477 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SKIV2LQ15477 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
SKIV2LQ15477 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
SKIV2LQ15477 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SKIV2LQ15477 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
SKIV2LQ15477 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SKIV2LQ15477 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SKIV2LQ15477 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150.2 ms