Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
UBE3CQ15386 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
UBE3CQ15386 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
UBE3CQ15386 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
UBE3CQ15386 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
UBE3CQ15386 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
UBE3CQ15386 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
UBE3CQ15386 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
UBE3CQ15386 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
UBE3CQ15386 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
UBE3CQ15386 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
UBE3CQ15386 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
UBE3CQ15386 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
UBE3CQ15386 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
UBE3CQ15386 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
UBE3CQ15386 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
UBE3CQ15386 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
UBE3CQ15386 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
UBE3CQ15386 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
UBE3CQ15386 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
UBE3CQ15386 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
UBE3CQ15386 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
UBE3CQ15386 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
UBE3CQ15386 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
UBE3CQ15386 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
UBE3CQ15386 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
UBE3CQ15386 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
UBE3CQ15386 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
UBE3CQ15386 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
UBE3CQ15386 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
UBE3CQ15386 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
UBE3CQ15386 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
UBE3CQ15386 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
UBE3CQ15386 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
UBE3CQ15386 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
UBE3CQ15386 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
UBE3CQ15386 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
UBE3CQ15386 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
UBE3CQ15386 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
UBE3CQ15386 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
UBE3CQ15386 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
UBE3CQ15386 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
UBE3CQ15386 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
UBE3CQ15386 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
UBE3CQ15386 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
UBE3CQ15386 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
UBE3CQ15386 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
UBE3CQ15386 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
UBE3CQ15386 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
UBE3CQ15386 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
UBE3CQ15386 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
UBE3CQ15386 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
UBE3CQ15386 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
UBE3CQ15386 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
UBE3CQ15386 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
UBE3CQ15386 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
UBE3CQ15386 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
UBE3CQ15386 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
UBE3CQ15386 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
UBE3CQ15386 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
UBE3CQ15386 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
UBE3CQ15386 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
UBE3CQ15386 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
UBE3CQ15386 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
UBE3CQ15386 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
UBE3CQ15386 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
UBE3CQ15386 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
UBE3CQ15386 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
UBE3CQ15386 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
UBE3CQ15386 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
UBE3CQ15386 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
UBE3CQ15386 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
UBE3CQ15386 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
UBE3CQ15386 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
UBE3CQ15386 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
UBE3CQ15386 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
UBE3CQ15386 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
UBE3CQ15386 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
UBE3CQ15386 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
UBE3CQ15386 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
UBE3CQ15386 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
UBE3CQ15386 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
UBE3CQ15386 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
UBE3CQ15386 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
UBE3CQ15386 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
UBE3CQ15386 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
UBE3CQ15386 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
UBE3CQ15386 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
UBE3CQ15386 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
UBE3CQ15386 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
UBE3CQ15386 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
UBE3CQ15386 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
UBE3CQ15386 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
UBE3CQ15386 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
UBE3CQ15386 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
UBE3CQ15386 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
UBE3CQ15386 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
UBE3CQ15386 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
UBE3CQ15386 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
UBE3CQ15386 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
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