Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 ANKRD36C-202ENST00000456556 5428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 KLRD1-204ENST00000381908 15549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 ZNF808-201ENST00000359798 3600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 AL161912.2-201ENST00000565707 3007 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 ADGRL2-205ENST00000370717 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 TARID-205ENST00000607033 2960 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 BCLAF1-214ENST00000531224 7263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 OTOGL-202ENST00000458043 8083 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 LZTFL1-216ENST00000539217 4113 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
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COL9A3Q14050 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC4.1□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 UNC13C-201ENST00000260323 12946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 PHEX-201ENST00000379374 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
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