Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 RNA5SP93-201ENST00000362525 114 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 CEP70-205ENST00000464035 1054 ntTSL 1 (best) BASIC-0.7□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 AF129408.1-201ENST00000608767 431 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 ZNF736P1Y-201ENST00000440402 1276 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC-0.7□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 AC025524.2-211ENST00000519990 1173 ntTSL 1 (best) BASIC-0.7□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 RNU6-374P-201ENST00000364146 108 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 EXOSC3P1-201ENST00000448649 500 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC-0.71□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC-0.71□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 PKIA-AS1-203ENST00000522807 692 ntTSL 3 BASIC-0.71□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 AC068643.2-202ENST00000552759 622 ntTSL 3 BASIC-0.71□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 Y_RNA.365-201ENST00000365537 102 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 AC004594.1-217ENST00000422260 325 ntTSL 2 BASIC-0.71□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC-0.71□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 LINC01218-201ENST00000515150 481 ntTSL 3 BASIC-0.71□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC-0.71□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 AL118556.1-201ENST00000555257 502 ntTSL 2 BASIC-0.71□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 AC138207.3-201ENST00000585289 166 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 RNU6-226P-201ENST00000363778 107 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 RNU4-27P-201ENST00000410889 139 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC-0.72□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 RPL32P14-201ENST00000463196 378 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC-0.72□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 RNU6-706P-201ENST00000517229 104 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 AP003168.1-201ENST00000530091 307 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC-0.72□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC-0.72□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 MTND5P13-201ENST00000513046 1079 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 DEFB130C-202ENST00000530001 230 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 AC087276.4-201ENST00000530042 444 ntTSL 3 BASIC-0.72□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 AC025423.2-201ENST00000537570 439 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 TMF1P1-201ENST00000576058 373 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 USP9YP19-201ENST00000412165 485 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC-0.73□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 AL356361.2-201ENST00000430542 443 ntTSL 3 BASIC-0.73□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 MTERF3-203ENST00000522822 1148 ntTSL 2 BASIC-0.73□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC-0.73□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.73□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 AC083799.1-201ENST00000366451 910 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC-0.73□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC-0.73□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 AC027338.1-201ENST00000514840 825 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
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