Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SNX13Q9Y5W8 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SNX13Q9Y5W8 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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SNX13Q9Y5W8 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SNX13Q9Y5W8 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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SNX13Q9Y5W8 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SNX13Q9Y5W8 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SNX13Q9Y5W8 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
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SNX13Q9Y5W8 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SNX13Q9Y5W8 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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SNX13Q9Y5W8 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SNX13Q9Y5W8 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
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SNX13Q9Y5W8 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
SNX13Q9Y5W8 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
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SNX13Q9Y5W8 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SNX13Q9Y5W8 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
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SNX13Q9Y5W8 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
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SNX13Q9Y5W8 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
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SNX13Q9Y5W8 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
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SNX13Q9Y5W8 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SNX13Q9Y5W8 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
SNX13Q9Y5W8 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SNX13Q9Y5W8 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.97
SNX13Q9Y5W8 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
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