Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 AC025524.2-211ENST00000519990 1173 ntTSL 1 (best) BASIC-0.32□□□□□ -2.46
NRXN1Q9ULB1 AL353778.1-201ENST00000603149 408 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
NRXN1Q9ULB1 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
NRXN1Q9ULB1 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
NRXN1Q9ULB1 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
NRXN1Q9ULB1 AC027338.1-201ENST00000514840 825 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
NRXN1Q9ULB1 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
NRXN1Q9ULB1 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
NRXN1Q9ULB1 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
NRXN1Q9ULB1 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
NRXN1Q9ULB1 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
NRXN1Q9ULB1 AL356094.1-201ENST00000624663 1212 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
NRXN1Q9ULB1 AC134980.1-208ENST00000640228 535 ntTSL 5 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
NRXN1Q9ULB1 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
NRXN1Q9ULB1 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
NRXN1Q9ULB1 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
NRXN1Q9ULB1 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
NRXN1Q9ULB1 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
NRXN1Q9ULB1 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
NRXN1Q9ULB1 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
NRXN1Q9ULB1 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
NRXN1Q9ULB1 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
NRXN1Q9ULB1 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
NRXN1Q9ULB1 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
NRXN1Q9ULB1 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
NRXN1Q9ULB1 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
NRXN1Q9ULB1 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
NRXN1Q9ULB1 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
NRXN1Q9ULB1 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
NRXN1Q9ULB1 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
NRXN1Q9ULB1 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
NRXN1Q9ULB1 RNU4-27P-201ENST00000410889 139 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
NRXN1Q9ULB1 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC-0.35□□□□□ -2.46
NRXN1Q9ULB1 LINC02462-201ENST00000503009 430 ntTSL 5 BASIC-0.35□□□□□ -2.46
NRXN1Q9ULB1 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC-0.35□□□□□ -2.46
NRXN1Q9ULB1 RNU6-320P-201ENST00000516511 106 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
NRXN1Q9ULB1 MIR4637-201ENST00000582405 84 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
NRXN1Q9ULB1 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC-0.35□□□□□ -2.46
NRXN1Q9ULB1 AC008759.3-201ENST00000613300 508 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
NRXN1Q9ULB1 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
NRXN1Q9ULB1 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
NRXN1Q9ULB1 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
NRXN1Q9ULB1 RPL39P6-201ENST00000448289 150 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
NRXN1Q9ULB1 AL008723.1-201ENST00000452181 590 ntTSL 5 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
NRXN1Q9ULB1 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
NRXN1Q9ULB1 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
NRXN1Q9ULB1 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC-0.35□□□□□ -2.47
NRXN1Q9ULB1 SNRPGP1-201ENST00000553864 222 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
NRXN1Q9ULB1 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
NRXN1Q9ULB1 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
NRXN1Q9ULB1 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
NRXN1Q9ULB1 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
NRXN1Q9ULB1 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
NRXN1Q9ULB1 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
NRXN1Q9ULB1 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
NRXN1Q9ULB1 SNORA32.3-201ENST00000384772 121 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
NRXN1Q9ULB1 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
NRXN1Q9ULB1 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
NRXN1Q9ULB1 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
NRXN1Q9ULB1 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
NRXN1Q9ULB1 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
NRXN1Q9ULB1 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
NRXN1Q9ULB1 MIR198-201ENST00000637333 62 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
NRXN1Q9ULB1 RNU6-1066P-201ENST00000363573 105 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
NRXN1Q9ULB1 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
NRXN1Q9ULB1 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
NRXN1Q9ULB1 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
NRXN1Q9ULB1 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
NRXN1Q9ULB1 RPF2P2-201ENST00000504693 896 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
NRXN1Q9ULB1 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
NRXN1Q9ULB1 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
NRXN1Q9ULB1 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
NRXN1Q9ULB1 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
NRXN1Q9ULB1 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
NRXN1Q9ULB1 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
NRXN1Q9ULB1 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
NRXN1Q9ULB1 AP000943.4-201ENST00000622912 357 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
NRXN1Q9ULB1 AC099654.9-201ENST00000637055 678 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
NRXN1Q9ULB1 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
NRXN1Q9ULB1 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
NRXN1Q9ULB1 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.38□□□□□ -2.47
NRXN1Q9ULB1 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
NRXN1Q9ULB1 MIR601-201ENST00000385256 79 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
NRXN1Q9ULB1 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC-0.38□□□□□ -2.47
NRXN1Q9ULB1 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
NRXN1Q9ULB1 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
NRXN1Q9ULB1 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
NRXN1Q9ULB1 SNORA76.2-201ENST00000517095 137 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
NRXN1Q9ULB1 AC091163.3-201ENST00000518269 1144 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
NRXN1Q9ULB1 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
NRXN1Q9ULB1 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
NRXN1Q9ULB1 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC-0.39□□□□□ -2.47
NRXN1Q9ULB1 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
NRXN1Q9ULB1 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
NRXN1Q9ULB1 AL606517.1-201ENST00000446914 387 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
NRXN1Q9ULB1 AL353148.1-203ENST00000452286 665 ntTSL 3 BASIC-0.39□□□□□ -2.47
NRXN1Q9ULB1 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC-0.39□□□□□ -2.47
NRXN1Q9ULB1 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
NRXN1Q9ULB1 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
NRXN1Q9ULB1 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105 ms