Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 AL049545.1-201ENST00000401856 572 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 CETN4P-201ENST00000432407 469 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 MTCO2P6-201ENST00000463134 685 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC1.19□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC1.19□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 SNORD116-8-201ENST00000384365 95 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC1.18□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC1.17□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC1.17□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.17□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC1.16□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 LINC01412-201ENST00000413525 362 ntTSL 2 BASIC1.16□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 MTCO2P16-201ENST00000436962 677 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.2 ms