Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
HIF1AQ16665 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
HIF1AQ16665 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
HIF1AQ16665 SLC26A7-209ENST00000617078 5094 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
HIF1AQ16665 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
HIF1AQ16665 C1orf112-203ENST00000413811 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
HIF1AQ16665 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
HIF1AQ16665 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
HIF1AQ16665 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
HIF1AQ16665 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
HIF1AQ16665 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
HIF1AQ16665 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
HIF1AQ16665 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
HIF1AQ16665 GALP-203ENST00000590002 150 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
HIF1AQ16665 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
HIF1AQ16665 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
HIF1AQ16665 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
HIF1AQ16665 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
HIF1AQ16665 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
HIF1AQ16665 SLITRK4-203ENST00000596188 8545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
HIF1AQ16665 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
HIF1AQ16665 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
HIF1AQ16665 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
HIF1AQ16665 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
HIF1AQ16665 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
HIF1AQ16665 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
HIF1AQ16665 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
HIF1AQ16665 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
HIF1AQ16665 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
HIF1AQ16665 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
HIF1AQ16665 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
HIF1AQ16665 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
HIF1AQ16665 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
HIF1AQ16665 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
HIF1AQ16665 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
HIF1AQ16665 HMGN2P8-201ENST00000391458 268 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
HIF1AQ16665 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
HIF1AQ16665 AC083863.1-201ENST00000438811 231 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
HIF1AQ16665 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
HIF1AQ16665 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
HIF1AQ16665 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
HIF1AQ16665 OR6A2-202ENST00000641196 4295 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
HIF1AQ16665 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
HIF1AQ16665 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
HIF1AQ16665 CRISPLD1-205ENST00000523524 2100 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
HIF1AQ16665 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
HIF1AQ16665 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
HIF1AQ16665 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
HIF1AQ16665 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
HIF1AQ16665 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
HIF1AQ16665 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
HIF1AQ16665 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
HIF1AQ16665 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
HIF1AQ16665 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
HIF1AQ16665 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC4.03□□□□□ -1.76
HIF1AQ16665 AC009292.2-201ENST00000558889 291 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
HIF1AQ16665 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
HIF1AQ16665 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
HIF1AQ16665 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
HIF1AQ16665 NR3C1-206ENST00000424646 4591 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
HIF1AQ16665 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 UACA-202ENST00000379983 4859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 VWA8P1-201ENST00000510889 176 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 MGA-211ENST00000570161 11859 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 ABCA12-202ENST00000389661 7005 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 MMS22L-202ENST00000369251 3949 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
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