Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CTF1Q16619 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CTF1Q16619 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
CTF1Q16619 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CTF1Q16619 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CTF1Q16619 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CTF1Q16619 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CTF1Q16619 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CTF1Q16619 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CTF1Q16619 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CTF1Q16619 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CTF1Q16619 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CTF1Q16619 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CTF1Q16619 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CTF1Q16619 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CTF1Q16619 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CTF1Q16619 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CTF1Q16619 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CTF1Q16619 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CTF1Q16619 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CTF1Q16619 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CTF1Q16619 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CTF1Q16619 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
CTF1Q16619 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CTF1Q16619 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
CTF1Q16619 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CTF1Q16619 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
CTF1Q16619 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CTF1Q16619 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CTF1Q16619 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CTF1Q16619 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CTF1Q16619 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CTF1Q16619 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CTF1Q16619 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CTF1Q16619 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CTF1Q16619 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CTF1Q16619 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CTF1Q16619 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CTF1Q16619 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CTF1Q16619 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CTF1Q16619 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CTF1Q16619 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CTF1Q16619 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CTF1Q16619 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CTF1Q16619 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CTF1Q16619 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CTF1Q16619 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CTF1Q16619 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CTF1Q16619 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CTF1Q16619 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CTF1Q16619 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CTF1Q16619 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CTF1Q16619 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CTF1Q16619 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CTF1Q16619 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CTF1Q16619 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CTF1Q16619 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CTF1Q16619 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CTF1Q16619 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CTF1Q16619 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CTF1Q16619 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CTF1Q16619 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CTF1Q16619 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CTF1Q16619 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CTF1Q16619 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CTF1Q16619 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CTF1Q16619 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CTF1Q16619 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CTF1Q16619 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CTF1Q16619 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CTF1Q16619 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CTF1Q16619 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CTF1Q16619 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CTF1Q16619 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CTF1Q16619 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CTF1Q16619 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CTF1Q16619 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CTF1Q16619 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CTF1Q16619 MIR4700-201ENST00000578311 74 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CTF1Q16619 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CTF1Q16619 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CTF1Q16619 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CTF1Q16619 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CTF1Q16619 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CTF1Q16619 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CTF1Q16619 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CTF1Q16619 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CTF1Q16619 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CTF1Q16619 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CTF1Q16619 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CTF1Q16619 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CTF1Q16619 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CTF1Q16619 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CTF1Q16619 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CTF1Q16619 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CTF1Q16619 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
CTF1Q16619 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CTF1Q16619 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CTF1Q16619 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CTF1Q16619 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.4 ms