Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ODF1Q14990 SNORA57.3-201ENST00000411095 141 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ODF1Q14990 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ODF1Q14990 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ODF1Q14990 TMSB10P2-201ENST00000416049 131 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ODF1Q14990 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ODF1Q14990 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ODF1Q14990 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ODF1Q14990 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ODF1Q14990 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ODF1Q14990 AC105914.2-201ENST00000507525 233 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ODF1Q14990 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ODF1Q14990 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ODF1Q14990 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ODF1Q14990 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ODF1Q14990 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ODF1Q14990 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ODF1Q14990 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ODF1Q14990 IPO5P1-202ENST00000600039 287 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ODF1Q14990 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ODF1Q14990 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
ODF1Q14990 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ODF1Q14990 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
ODF1Q14990 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ODF1Q14990 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
ODF1Q14990 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ODF1Q14990 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ODF1Q14990 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ODF1Q14990 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ODF1Q14990 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ODF1Q14990 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ODF1Q14990 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ODF1Q14990 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ODF1Q14990 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ODF1Q14990 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ODF1Q14990 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ODF1Q14990 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ODF1Q14990 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ODF1Q14990 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ODF1Q14990 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ODF1Q14990 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ODF1Q14990 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ODF1Q14990 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ODF1Q14990 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ODF1Q14990 AC006011.1-201ENST00000442758 349 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ODF1Q14990 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ODF1Q14990 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ODF1Q14990 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ODF1Q14990 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ODF1Q14990 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ODF1Q14990 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ODF1Q14990 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ODF1Q14990 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ODF1Q14990 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
ODF1Q14990 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ODF1Q14990 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
ODF1Q14990 RNU1-14P-201ENST00000362759 152 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ODF1Q14990 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ODF1Q14990 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ODF1Q14990 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ODF1Q14990 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ODF1Q14990 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ODF1Q14990 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ODF1Q14990 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ODF1Q14990 AL136084.2-202ENST00000433997 353 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ODF1Q14990 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ODF1Q14990 RNA5SP246-201ENST00000458909 119 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ODF1Q14990 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ODF1Q14990 AF213884.1-201ENST00000488102 463 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ODF1Q14990 RN7SL604P-201ENST00000492589 296 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ODF1Q14990 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ODF1Q14990 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ODF1Q14990 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ODF1Q14990 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ODF1Q14990 AC113403.1-201ENST00000604910 193 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ODF1Q14990 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ODF1Q14990 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ODF1Q14990 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ODF1Q14990 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
ODF1Q14990 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
ODF1Q14990 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
ODF1Q14990 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ODF1Q14990 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
ODF1Q14990 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ODF1Q14990 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
ODF1Q14990 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ODF1Q14990 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ODF1Q14990 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ODF1Q14990 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ODF1Q14990 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ODF1Q14990 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ODF1Q14990 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ODF1Q14990 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ODF1Q14990 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ODF1Q14990 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ODF1Q14990 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ODF1Q14990 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ODF1Q14990 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ODF1Q14990 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ODF1Q14990 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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