Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CKAP5Q14008 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CKAP5Q14008 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CKAP5Q14008 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CKAP5Q14008 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CKAP5Q14008 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CKAP5Q14008 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CKAP5Q14008 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CKAP5Q14008 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CKAP5Q14008 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CKAP5Q14008 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CKAP5Q14008 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CKAP5Q14008 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CKAP5Q14008 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CKAP5Q14008 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CKAP5Q14008 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CKAP5Q14008 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
CKAP5Q14008 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CKAP5Q14008 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CKAP5Q14008 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
CKAP5Q14008 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CKAP5Q14008 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CKAP5Q14008 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CKAP5Q14008 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CKAP5Q14008 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CKAP5Q14008 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CKAP5Q14008 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CKAP5Q14008 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CKAP5Q14008 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CKAP5Q14008 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CKAP5Q14008 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CKAP5Q14008 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CKAP5Q14008 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CKAP5Q14008 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CKAP5Q14008 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CKAP5Q14008 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CKAP5Q14008 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CKAP5Q14008 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC2.59□□□□□ -2
CKAP5Q14008 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC2.59□□□□□ -2
CKAP5Q14008 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC2.59□□□□□ -2
CKAP5Q14008 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC2.59□□□□□ -2
CKAP5Q14008 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC2.59□□□□□ -2
CKAP5Q14008 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC2.59□□□□□ -2
CKAP5Q14008 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC2.59□□□□□ -2
CKAP5Q14008 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC2.59□□□□□ -2
CKAP5Q14008 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
CKAP5Q14008 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
CKAP5Q14008 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC2.59□□□□□ -2
CKAP5Q14008 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC2.59□□□□□ -2
CKAP5Q14008 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC2.59□□□□□ -2
CKAP5Q14008 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC2.59□□□□□ -2
CKAP5Q14008 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
CKAP5Q14008 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.59□□□□□ -2
CKAP5Q14008 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
CKAP5Q14008 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CKAP5Q14008 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CKAP5Q14008 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
CKAP5Q14008 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
CKAP5Q14008 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
CKAP5Q14008 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CKAP5Q14008 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CKAP5Q14008 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CKAP5Q14008 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CKAP5Q14008 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CKAP5Q14008 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CKAP5Q14008 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CKAP5Q14008 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CKAP5Q14008 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CKAP5Q14008 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CKAP5Q14008 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CKAP5Q14008 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CKAP5Q14008 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CKAP5Q14008 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CKAP5Q14008 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CKAP5Q14008 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CKAP5Q14008 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
CKAP5Q14008 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
CKAP5Q14008 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
CKAP5Q14008 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
CKAP5Q14008 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CKAP5Q14008 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CKAP5Q14008 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CKAP5Q14008 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CKAP5Q14008 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CKAP5Q14008 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CKAP5Q14008 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CKAP5Q14008 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CKAP5Q14008 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CKAP5Q14008 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
CKAP5Q14008 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CKAP5Q14008 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CKAP5Q14008 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CKAP5Q14008 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CKAP5Q14008 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CKAP5Q14008 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CKAP5Q14008 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CKAP5Q14008 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
CKAP5Q14008 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
CKAP5Q14008 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CKAP5Q14008 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
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