Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC0.92□□□□□ -2.26
APOFQ13790 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
APOFQ13790 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.92□□□□□ -2.26
APOFQ13790 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
APOFQ13790 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
APOFQ13790 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
APOFQ13790 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
APOFQ13790 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
APOFQ13790 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
APOFQ13790 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
APOFQ13790 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
APOFQ13790 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
APOFQ13790 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
APOFQ13790 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
APOFQ13790 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
APOFQ13790 AC008568.1-203ENST00000433406 765 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
APOFQ13790 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
APOFQ13790 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
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APOFQ13790 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
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APOFQ13790 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
APOFQ13790 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
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APOFQ13790 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
APOFQ13790 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
APOFQ13790 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
APOFQ13790 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
APOFQ13790 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
APOFQ13790 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
APOFQ13790 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
APOFQ13790 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
APOFQ13790 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
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APOFQ13790 AC090616.2-202ENST00000584248 222 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
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APOFQ13790 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC0.89□□□□□ -2.27
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APOFQ13790 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
APOFQ13790 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
APOFQ13790 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
APOFQ13790 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.89□□□□□ -2.27
APOFQ13790 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
APOFQ13790 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
APOFQ13790 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
APOFQ13790 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
APOFQ13790 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
APOFQ13790 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
APOFQ13790 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
APOFQ13790 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
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