Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
C1orf61Q13536 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
C1orf61Q13536 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
C1orf61Q13536 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
C1orf61Q13536 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
C1orf61Q13536 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
C1orf61Q13536 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
C1orf61Q13536 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
C1orf61Q13536 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
C1orf61Q13536 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
C1orf61Q13536 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
C1orf61Q13536 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
C1orf61Q13536 AP000568.1-201ENST00000282964 442 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
C1orf61Q13536 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
C1orf61Q13536 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
C1orf61Q13536 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
C1orf61Q13536 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
C1orf61Q13536 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
C1orf61Q13536 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
C1orf61Q13536 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
C1orf61Q13536 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
C1orf61Q13536 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
C1orf61Q13536 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
C1orf61Q13536 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
C1orf61Q13536 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
C1orf61Q13536 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
C1orf61Q13536 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
C1orf61Q13536 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
C1orf61Q13536 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
C1orf61Q13536 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
C1orf61Q13536 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
C1orf61Q13536 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
C1orf61Q13536 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
C1orf61Q13536 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
C1orf61Q13536 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
C1orf61Q13536 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
C1orf61Q13536 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
C1orf61Q13536 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
C1orf61Q13536 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC1.52□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 AC119751.7-201ENST00000600494 245 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.51□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.5□□□□□ -2.17
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