Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

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Length 285 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TIMMDC1Q9NPL8 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TIMMDC1Q9NPL8 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TIMMDC1Q9NPL8 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TIMMDC1Q9NPL8 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TIMMDC1Q9NPL8 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TIMMDC1Q9NPL8 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TIMMDC1Q9NPL8 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TIMMDC1Q9NPL8 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TIMMDC1Q9NPL8 PPP1R9A-208ENST00000456331 10090 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
TIMMDC1Q9NPL8 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
TIMMDC1Q9NPL8 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.74
TIMMDC1Q9NPL8 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
TIMMDC1Q9NPL8 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
TIMMDC1Q9NPL8 AGTR2-201ENST00000371906 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 NDUFS5P3-201ENST00000450668 321 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 IGLVIV-65-201ENST00000517313 360 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 MIR486-1-201ENST00000612171 68 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 AC244196.2-201ENST00000621184 411 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.15□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 WDR72-204ENST00000559418 3602 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL585P-201ENST00000470538 280 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02017-201ENST00000496829 474 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 AC016597.1-201ENST00000564893 528 ntTSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 PCDH11X-206ENST00000373097 9146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 SELENOI-201ENST00000260585 8101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 OR1A1-202ENST00000641322 3743 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 AL732292.1-201ENST00000426692 226 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 AC105940.1-201ENST00000434265 353 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 AC007099.2-201ENST00000444852 336 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 AC012671.1-201ENST00000451912 203 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 CPHL1P-201ENST00000461341 3407 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 ECT2-204ENST00000392692 4158 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 AC093274.1-201ENST00000503488 5454 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 GMNC-201ENST00000442080 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 KCNJ16-201ENST00000283936 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
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