Protein–RNA interactions for Protein: Q96T88

UHRF1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UHRF1Q96T88 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
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