Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
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