Protein–RNA interactions for Protein: Q70EK8

USP53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP53Q70EK8 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
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USP53Q70EK8 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
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USP53Q70EK8 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
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USP53Q70EK8 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
USP53Q70EK8 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
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USP53Q70EK8 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
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USP53Q70EK8 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
USP53Q70EK8 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
USP53Q70EK8 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
USP53Q70EK8 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
USP53Q70EK8 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
USP53Q70EK8 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
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USP53Q70EK8 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
USP53Q70EK8 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
USP53Q70EK8 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
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USP53Q70EK8 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
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USP53Q70EK8 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
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USP53Q70EK8 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
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USP53Q70EK8 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
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USP53Q70EK8 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
USP53Q70EK8 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
USP53Q70EK8 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
USP53Q70EK8 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
USP53Q70EK8 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
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USP53Q70EK8 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
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USP53Q70EK8 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
USP53Q70EK8 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
USP53Q70EK8 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
USP53Q70EK8 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
USP53Q70EK8 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
USP53Q70EK8 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
USP53Q70EK8 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
USP53Q70EK8 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
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