Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 HEATR5B-201ENST00000233099 6905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 DPRX-201ENST00000376650 648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 AL451081.1-201ENST00000413159 245 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 ODF2-AS1-201ENST00000420801 407 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 AC004824.1-201ENST00000439577 311 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 AL356121.1-201ENST00000442911 156 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 ACA64.1-201ENST00000459171 127 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 RN7SL610P-201ENST00000463845 291 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 RN7SL97P-201ENST00000486780 299 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 DLG1-217ENST00000452595 3053 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 SNORA74A-201ENST00000364089 198 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 AC018797.1-201ENST00000510791 255 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 AL160290.3-201ENST00000604869 165 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 ETV1-202ENST00000399357 6096 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC3.16□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 TMEM267-201ENST00000397080 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 MGA-211ENST00000570161 11859 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 AC079741.1-201ENST00000321498 212 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP213-201ENST00000410746 298 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 RN7SL172P-201ENST00000460535 303 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 SNRPCP11-201ENST00000492453 205 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 AC130371.1-201ENST00000577023 230 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 AC092364.1-202ENST00000593824 565 ntTSL 4 BASIC3.15□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 AC083809.1-201ENST00000615051 472 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 AC140479.6-201ENST00000633535 357 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
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