Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
RTN1Q16799 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
RTN1Q16799 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
RTN1Q16799 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
RTN1Q16799 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
RTN1Q16799 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
RTN1Q16799 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
RTN1Q16799 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
RTN1Q16799 CD80-201ENST00000264246 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
RTN1Q16799 C1orf112-203ENST00000413811 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
RTN1Q16799 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
RTN1Q16799 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
RTN1Q16799 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
RTN1Q16799 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
RTN1Q16799 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
RTN1Q16799 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
RTN1Q16799 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
RTN1Q16799 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
RTN1Q16799 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
RTN1Q16799 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
RTN1Q16799 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
RTN1Q16799 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
RTN1Q16799 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
RTN1Q16799 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
RTN1Q16799 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
RTN1Q16799 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
RTN1Q16799 AL033397.1-201ENST00000502390 3653 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
RTN1Q16799 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
RTN1Q16799 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
RTN1Q16799 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
RTN1Q16799 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
RTN1Q16799 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
RTN1Q16799 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
RTN1Q16799 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
RTN1Q16799 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
RTN1Q16799 RGPD1-202ENST00000409776 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
RTN1Q16799 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
RTN1Q16799 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
RTN1Q16799 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
RTN1Q16799 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
RTN1Q16799 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
RTN1Q16799 AL133412.1-201ENST00000380194 2992 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
RTN1Q16799 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
RTN1Q16799 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
RTN1Q16799 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
RTN1Q16799 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
RTN1Q16799 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
RTN1Q16799 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
RTN1Q16799 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
RTN1Q16799 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
RTN1Q16799 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
RTN1Q16799 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
RTN1Q16799 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
RTN1Q16799 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
RTN1Q16799 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
RTN1Q16799 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
RTN1Q16799 AC020914.4-201ENST00000597690 277 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
RTN1Q16799 AC025946.2-201ENST00000603398 234 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
RTN1Q16799 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
RTN1Q16799 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
RTN1Q16799 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
RTN1Q16799 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
RTN1Q16799 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
RTN1Q16799 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
RTN1Q16799 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
RTN1Q16799 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
RTN1Q16799 AC023669.2-201ENST00000436266 239 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
RTN1Q16799 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
RTN1Q16799 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
RTN1Q16799 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
RTN1Q16799 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
RTN1Q16799 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
RTN1Q16799 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
RTN1Q16799 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
RTN1Q16799 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
RTN1Q16799 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
RTN1Q16799 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
RTN1Q16799 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
RTN1Q16799 ORMDL1-201ENST00000325795 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
RTN1Q16799 FKTN-201ENST00000223528 7364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
RTN1Q16799 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
RTN1Q16799 PTPN22-202ENST00000420377 2726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
RTN1Q16799 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RTN1Q16799 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RTN1Q16799 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC4.22□□□□□ -1.73
RTN1Q16799 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RTN1Q16799 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC4.22□□□□□ -1.73
RTN1Q16799 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RTN1Q16799 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RTN1Q16799 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RTN1Q16799 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
RTN1Q16799 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
RTN1Q16799 LINC01247-201ENST00000448901 4209 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
RTN1Q16799 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
RTN1Q16799 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
RTN1Q16799 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
RTN1Q16799 ADGRL4-201ENST00000370742 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.73
RTN1Q16799 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
RTN1Q16799 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
RTN1Q16799 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
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