Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 USP9YP25-201ENST00000457708 443 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.86□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 AC006927.4-201ENST00000639187 543 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 RNU6-1242P-201ENST00000391052 103 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 AC084290.1-201ENST00000434995 374 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 EXOSC3P1-201ENST00000448649 500 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 OCIAD1-AS1-201ENST00000513576 265 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 AC078880.1-201ENST00000546696 553 ntTSL 4 BASIC0.85□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 AC018645.2-201ENST00000609151 472 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 HIGD1AP15-201ENST00000416198 280 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC0.84□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 snoU109.3-201ENST00000459477 145 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 AC013410.2-201ENST00000422627 201 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC0.83□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 AC019226.2-201ENST00000625973 424 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.82□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC0.82□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC0.82□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC0.82□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 ZNF321P-202ENST00000550843 495 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.81□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.4 ms