Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 SNORA72.7-201ENST00000516349 94 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 MIR5684-201ENST00000585074 65 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 AL589745.1-201ENST00000421190 3336 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 ZFYVE16-201ENST00000338008 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 RNA5SP22-201ENST00000365393 109 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
NKX1-1Q15270 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
NKX1-1Q15270 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
NKX1-1Q15270 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NKX1-1Q15270 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
NKX1-1Q15270 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
NKX1-1Q15270 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NKX1-1Q15270 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NKX1-1Q15270 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NKX1-1Q15270 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NKX1-1Q15270 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NKX1-1Q15270 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NKX1-1Q15270 SNRPGP5-201ENST00000456003 220 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NKX1-1Q15270 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NKX1-1Q15270 GNRHR2P1-201ENST00000555315 631 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NKX1-1Q15270 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NKX1-1Q15270 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NKX1-1Q15270 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NKX1-1Q15270 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NKX1-1Q15270 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NKX1-1Q15270 AC140113.4-201ENST00000622087 222 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NKX1-1Q15270 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
NKX1-1Q15270 ADGRG2-203ENST00000356606 4630 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
NKX1-1Q15270 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NKX1-1Q15270 DOCK7-219ENST00000635253 6423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NKX1-1Q15270 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
NKX1-1Q15270 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
NKX1-1Q15270 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NKX1-1Q15270 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NKX1-1Q15270 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
NKX1-1Q15270 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
NKX1-1Q15270 CNOT10-206ENST00000454516 2760 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NKX1-1Q15270 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
NKX1-1Q15270 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NKX1-1Q15270 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NKX1-1Q15270 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NKX1-1Q15270 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NKX1-1Q15270 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NKX1-1Q15270 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NKX1-1Q15270 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NKX1-1Q15270 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NKX1-1Q15270 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
NKX1-1Q15270 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NKX1-1Q15270 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
NKX1-1Q15270 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NKX1-1Q15270 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NKX1-1Q15270 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NKX1-1Q15270 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NKX1-1Q15270 ZNF107-203ENST00000395391 6094 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NKX1-1Q15270 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NKX1-1Q15270 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NKX1-1Q15270 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NKX1-1Q15270 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NKX1-1Q15270 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NKX1-1Q15270 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NKX1-1Q15270 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NKX1-1Q15270 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NKX1-1Q15270 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
NKX1-1Q15270 FAM169A-203ENST00000510496 5810 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NKX1-1Q15270 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NKX1-1Q15270 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NKX1-1Q15270 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NKX1-1Q15270 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NKX1-1Q15270 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
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