Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 MIR432-201ENST00000606207 94 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 MCF2-201ENST00000338585 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 NCOA1-201ENST00000288599 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 SLC5A12-202ENST00000396005 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 ABCA12-202ENST00000389661 7005 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 AL691497.1-201ENST00000443270 449 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 ZNF208-207ENST00000609966 3653 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 MBNL1-211ENST00000463374 5092 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 DMD-229ENST00000619831 13734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
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COL19A1Q14993 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
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COL19A1Q14993 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
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COL19A1Q14993 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
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COL19A1Q14993 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
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COL19A1Q14993 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
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COL19A1Q14993 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 FAM169A-203ENST00000510496 5810 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 DAZ4-202ENST00000382314 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
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