Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
ODF1Q14990 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
ODF1Q14990 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ODF1Q14990 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ODF1Q14990 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ODF1Q14990 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ODF1Q14990 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ODF1Q14990 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ODF1Q14990 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ODF1Q14990 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ODF1Q14990 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ODF1Q14990 AL157831.1-201ENST00000426134 473 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ODF1Q14990 COX6B1P7-201ENST00000430845 235 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ODF1Q14990 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ODF1Q14990 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ODF1Q14990 UQCRHP4-201ENST00000471686 272 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ODF1Q14990 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ODF1Q14990 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ODF1Q14990 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ODF1Q14990 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ODF1Q14990 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ODF1Q14990 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ODF1Q14990 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ODF1Q14990 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ODF1Q14990 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ODF1Q14990 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ODF1Q14990 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
ODF1Q14990 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ODF1Q14990 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ODF1Q14990 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
ODF1Q14990 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
ODF1Q14990 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ODF1Q14990 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
ODF1Q14990 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ODF1Q14990 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
ODF1Q14990 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ODF1Q14990 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ODF1Q14990 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ODF1Q14990 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ODF1Q14990 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ODF1Q14990 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ODF1Q14990 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ODF1Q14990 RPL23AP46-201ENST00000438548 490 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ODF1Q14990 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ODF1Q14990 RPL29P14-201ENST00000495837 428 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ODF1Q14990 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ODF1Q14990 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ODF1Q14990 DAZAP2-209ENST00000549732 601 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ODF1Q14990 NUDT7-203ENST00000563839 316 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ODF1Q14990 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ODF1Q14990 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ODF1Q14990 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ODF1Q14990 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
ODF1Q14990 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ODF1Q14990 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ODF1Q14990 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
ODF1Q14990 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ODF1Q14990 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
ODF1Q14990 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ODF1Q14990 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ODF1Q14990 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ODF1Q14990 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ODF1Q14990 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ODF1Q14990 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ODF1Q14990 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ODF1Q14990 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ODF1Q14990 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ODF1Q14990 AL356387.2-201ENST00000422272 243 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ODF1Q14990 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ODF1Q14990 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ODF1Q14990 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ODF1Q14990 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ODF1Q14990 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ODF1Q14990 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ODF1Q14990 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ODF1Q14990 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ODF1Q14990 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ODF1Q14990 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ODF1Q14990 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ODF1Q14990 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ODF1Q14990 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ODF1Q14990 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ODF1Q14990 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ODF1Q14990 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ODF1Q14990 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ODF1Q14990 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ODF1Q14990 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ODF1Q14990 AC114781.5-201ENST00000615297 108 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ODF1Q14990 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ODF1Q14990 uc_338.13-201ENST00000618243 179 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ODF1Q14990 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ODF1Q14990 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
ODF1Q14990 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
ODF1Q14990 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ODF1Q14990 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
ODF1Q14990 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ODF1Q14990 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ODF1Q14990 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ODF1Q14990 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ODF1Q14990 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.5 ms