Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
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GBX1Q14549 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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GBX1Q14549 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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GBX1Q14549 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
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