Protein–RNA interactions for Protein: Q14515

SPARCL1, SPARC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPARCL1Q14515 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SPARCL1Q14515 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SPARCL1Q14515 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SPARCL1Q14515 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SPARCL1Q14515 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SPARCL1Q14515 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SPARCL1Q14515 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SPARCL1Q14515 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SPARCL1Q14515 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SPARCL1Q14515 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SPARCL1Q14515 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SPARCL1Q14515 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SPARCL1Q14515 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SPARCL1Q14515 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SPARCL1Q14515 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SPARCL1Q14515 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
SPARCL1Q14515 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SPARCL1Q14515 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SPARCL1Q14515 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SPARCL1Q14515 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SPARCL1Q14515 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SPARCL1Q14515 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SPARCL1Q14515 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SPARCL1Q14515 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SPARCL1Q14515 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SPARCL1Q14515 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SPARCL1Q14515 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SPARCL1Q14515 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SPARCL1Q14515 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SPARCL1Q14515 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SPARCL1Q14515 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SPARCL1Q14515 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SPARCL1Q14515 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SPARCL1Q14515 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SPARCL1Q14515 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SPARCL1Q14515 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SPARCL1Q14515 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SPARCL1Q14515 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SPARCL1Q14515 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SPARCL1Q14515 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SPARCL1Q14515 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SPARCL1Q14515 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SPARCL1Q14515 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SPARCL1Q14515 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SPARCL1Q14515 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SPARCL1Q14515 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
SPARCL1Q14515 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
SPARCL1Q14515 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SPARCL1Q14515 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SPARCL1Q14515 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SPARCL1Q14515 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SPARCL1Q14515 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SPARCL1Q14515 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SPARCL1Q14515 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SPARCL1Q14515 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SPARCL1Q14515 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SPARCL1Q14515 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SPARCL1Q14515 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SPARCL1Q14515 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SPARCL1Q14515 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SPARCL1Q14515 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SPARCL1Q14515 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SPARCL1Q14515 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SPARCL1Q14515 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SPARCL1Q14515 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SPARCL1Q14515 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SPARCL1Q14515 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SPARCL1Q14515 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SPARCL1Q14515 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SPARCL1Q14515 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SPARCL1Q14515 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SPARCL1Q14515 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SPARCL1Q14515 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SPARCL1Q14515 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SPARCL1Q14515 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SPARCL1Q14515 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SPARCL1Q14515 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SPARCL1Q14515 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SPARCL1Q14515 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SPARCL1Q14515 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SPARCL1Q14515 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SPARCL1Q14515 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SPARCL1Q14515 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SPARCL1Q14515 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SPARCL1Q14515 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SPARCL1Q14515 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SPARCL1Q14515 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SPARCL1Q14515 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SPARCL1Q14515 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SPARCL1Q14515 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SPARCL1Q14515 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SPARCL1Q14515 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SPARCL1Q14515 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SPARCL1Q14515 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SPARCL1Q14515 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SPARCL1Q14515 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SPARCL1Q14515 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SPARCL1Q14515 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SPARCL1Q14515 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
SPARCL1Q14515 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
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