Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC4.35□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC4.35□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 SLCO1B1-201ENST00000256958 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC4.35□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
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