Protein–RNA interactions for Protein: Q13231

CHIT1, Chitotriosidase-1, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIT1Q13231 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CHIT1Q13231 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CHIT1Q13231 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CHIT1Q13231 AL360219.1-201ENST00000610230 366 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CHIT1Q13231 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CHIT1Q13231 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CHIT1Q13231 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CHIT1Q13231 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
CHIT1Q13231 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CHIT1Q13231 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CHIT1Q13231 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CHIT1Q13231 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CHIT1Q13231 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
CHIT1Q13231 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CHIT1Q13231 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC1.43□□□□□ -2.18
CHIT1Q13231 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC1.43□□□□□ -2.18
CHIT1Q13231 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CHIT1Q13231 LINC02462-201ENST00000503009 430 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
CHIT1Q13231 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC1.43□□□□□ -2.18
CHIT1Q13231 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC1.43□□□□□ -2.18
CHIT1Q13231 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
CHIT1Q13231 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
CHIT1Q13231 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CHIT1Q13231 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CHIT1Q13231 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CHIT1Q13231 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CHIT1Q13231 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.43□□□□□ -2.18
CHIT1Q13231 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CHIT1Q13231 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CHIT1Q13231 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
CHIT1Q13231 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CHIT1Q13231 DMD-AS3-201ENST00000439592 293 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
CHIT1Q13231 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CHIT1Q13231 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
CHIT1Q13231 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
CHIT1Q13231 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
CHIT1Q13231 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CHIT1Q13231 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CHIT1Q13231 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CHIT1Q13231 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
CHIT1Q13231 MTCO3P28-201ENST00000513351 515 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CHIT1Q13231 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CHIT1Q13231 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CHIT1Q13231 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CHIT1Q13231 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CHIT1Q13231 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CHIT1Q13231 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CHIT1Q13231 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CHIT1Q13231 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CHIT1Q13231 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CHIT1Q13231 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CHIT1Q13231 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CHIT1Q13231 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CHIT1Q13231 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CHIT1Q13231 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CHIT1Q13231 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CHIT1Q13231 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
CHIT1Q13231 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CHIT1Q13231 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
CHIT1Q13231 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CHIT1Q13231 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CHIT1Q13231 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CHIT1Q13231 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CHIT1Q13231 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.41□□□□□ -2.18
CHIT1Q13231 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
CHIT1Q13231 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
CHIT1Q13231 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CHIT1Q13231 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CHIT1Q13231 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CHIT1Q13231 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CHIT1Q13231 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CHIT1Q13231 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.19
CHIT1Q13231 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CHIT1Q13231 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CHIT1Q13231 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CHIT1Q13231 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
CHIT1Q13231 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.19
CHIT1Q13231 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CHIT1Q13231 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CHIT1Q13231 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
CHIT1Q13231 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CHIT1Q13231 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.19
CHIT1Q13231 AC092142.2-201ENST00000614642 354 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
CHIT1Q13231 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
CHIT1Q13231 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CHIT1Q13231 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.39□□□□□ -2.19
CHIT1Q13231 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CHIT1Q13231 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CHIT1Q13231 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CHIT1Q13231 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CHIT1Q13231 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CHIT1Q13231 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CHIT1Q13231 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CHIT1Q13231 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CHIT1Q13231 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
CHIT1Q13231 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CHIT1Q13231 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CHIT1Q13231 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CHIT1Q13231 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
CHIT1Q13231 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.2 ms