Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
FOXO1Q12778 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
FOXO1Q12778 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
FOXO1Q12778 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
FOXO1Q12778 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
FOXO1Q12778 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
FOXO1Q12778 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
FOXO1Q12778 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC2.65□□□□□ -1.99
FOXO1Q12778 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
FOXO1Q12778 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
FOXO1Q12778 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
FOXO1Q12778 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
FOXO1Q12778 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
FOXO1Q12778 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
FOXO1Q12778 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
FOXO1Q12778 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
FOXO1Q12778 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
FOXO1Q12778 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
FOXO1Q12778 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
FOXO1Q12778 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
FOXO1Q12778 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
FOXO1Q12778 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
FOXO1Q12778 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
FOXO1Q12778 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
FOXO1Q12778 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
FOXO1Q12778 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
FOXO1Q12778 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
FOXO1Q12778 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
FOXO1Q12778 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
FOXO1Q12778 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
FOXO1Q12778 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
FOXO1Q12778 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
FOXO1Q12778 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
FOXO1Q12778 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
FOXO1Q12778 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
FOXO1Q12778 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
FOXO1Q12778 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
FOXO1Q12778 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
FOXO1Q12778 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
FOXO1Q12778 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
FOXO1Q12778 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
FOXO1Q12778 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
FOXO1Q12778 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
FOXO1Q12778 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
FOXO1Q12778 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
FOXO1Q12778 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
FOXO1Q12778 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
FOXO1Q12778 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
FOXO1Q12778 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
FOXO1Q12778 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
FOXO1Q12778 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
FOXO1Q12778 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
FOXO1Q12778 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
FOXO1Q12778 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
FOXO1Q12778 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
FOXO1Q12778 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
FOXO1Q12778 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
FOXO1Q12778 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
FOXO1Q12778 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
FOXO1Q12778 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
FOXO1Q12778 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
FOXO1Q12778 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
FOXO1Q12778 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
FOXO1Q12778 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
FOXO1Q12778 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
FOXO1Q12778 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
FOXO1Q12778 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
FOXO1Q12778 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
FOXO1Q12778 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
FOXO1Q12778 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
FOXO1Q12778 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
FOXO1Q12778 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
FOXO1Q12778 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
FOXO1Q12778 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
FOXO1Q12778 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
FOXO1Q12778 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
FOXO1Q12778 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
FOXO1Q12778 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
FOXO1Q12778 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
FOXO1Q12778 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
FOXO1Q12778 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
FOXO1Q12778 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
FOXO1Q12778 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
FOXO1Q12778 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
FOXO1Q12778 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
FOXO1Q12778 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
FOXO1Q12778 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
FOXO1Q12778 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
FOXO1Q12778 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
FOXO1Q12778 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
FOXO1Q12778 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
FOXO1Q12778 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.62□□□□□ -1.99
FOXO1Q12778 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC2.62□□□□□ -1.99
FOXO1Q12778 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.62□□□□□ -1.99
FOXO1Q12778 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
FOXO1Q12778 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
FOXO1Q12778 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
FOXO1Q12778 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
FOXO1Q12778 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
FOXO1Q12778 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
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