Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 MIR6748-201ENST00000610433 71 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
VPREB1P12018 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
VPREB1P12018 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
VPREB1P12018 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
VPREB1P12018 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
VPREB1P12018 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
VPREB1P12018 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
VPREB1P12018 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
VPREB1P12018 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
VPREB1P12018 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
VPREB1P12018 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.09
VPREB1P12018 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
VPREB1P12018 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
VPREB1P12018 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
VPREB1P12018 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
VPREB1P12018 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
VPREB1P12018 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
VPREB1P12018 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
VPREB1P12018 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
VPREB1P12018 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
VPREB1P12018 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.02□□□□□ -2.09
VPREB1P12018 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
VPREB1P12018 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
VPREB1P12018 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
VPREB1P12018 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
VPREB1P12018 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
VPREB1P12018 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
VPREB1P12018 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
VPREB1P12018 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
VPREB1P12018 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC2.02□□□□□ -2.09
VPREB1P12018 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC2.02□□□□□ -2.09
VPREB1P12018 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
VPREB1P12018 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
VPREB1P12018 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
VPREB1P12018 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
VPREB1P12018 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
VPREB1P12018 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
VPREB1P12018 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
VPREB1P12018 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
VPREB1P12018 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
VPREB1P12018 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
VPREB1P12018 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
VPREB1P12018 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
VPREB1P12018 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
VPREB1P12018 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
VPREB1P12018 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
VPREB1P12018 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
VPREB1P12018 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
VPREB1P12018 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
VPREB1P12018 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
VPREB1P12018 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
VPREB1P12018 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
VPREB1P12018 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
VPREB1P12018 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
VPREB1P12018 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
VPREB1P12018 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
VPREB1P12018 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
VPREB1P12018 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
VPREB1P12018 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
VPREB1P12018 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
VPREB1P12018 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
VPREB1P12018 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
VPREB1P12018 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
VPREB1P12018 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
VPREB1P12018 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC2.01□□□□□ -2.09
VPREB1P12018 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
VPREB1P12018 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
VPREB1P12018 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
VPREB1P12018 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
VPREB1P12018 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
VPREB1P12018 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
VPREB1P12018 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
VPREB1P12018 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
VPREB1P12018 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
VPREB1P12018 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
VPREB1P12018 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
VPREB1P12018 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
VPREB1P12018 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
VPREB1P12018 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
VPREB1P12018 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC2□□□□□ -2.09
VPREB1P12018 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
VPREB1P12018 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC2□□□□□ -2.09
VPREB1P12018 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
VPREB1P12018 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC2□□□□□ -2.09
VPREB1P12018 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
VPREB1P12018 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC2□□□□□ -2.09
VPREB1P12018 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC2□□□□□ -2.09
VPREB1P12018 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
VPREB1P12018 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC2□□□□□ -2.09
VPREB1P12018 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC2□□□□□ -2.09
VPREB1P12018 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC2□□□□□ -2.09
VPREB1P12018 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC2□□□□□ -2.09
VPREB1P12018 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
VPREB1P12018 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC2□□□□□ -2.09
VPREB1P12018 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC2□□□□□ -2.09
VPREB1P12018 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC2□□□□□ -2.09
VPREB1P12018 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
VPREB1P12018 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC2□□□□□ -2.09
VPREB1P12018 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC2□□□□□ -2.09
VPREB1P12018 AC144836.1-201ENST00000575911 340 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.3 ms