Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 CNTRL-201ENST00000238341 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 RN7SL481P-201ENST00000477764 299 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 AC105137.1-201ENST00000484355 562 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 CDH8-205ENST00000577730 8009 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 AL360270.1-201ENST00000440689 2359 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 MIR181A1HG-203ENST00000436880 2308 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 LINC02458-201ENST00000500381 2941 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 A2MP1-204ENST00000566278 4130 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 CYP19A1-201ENST00000396402 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 STON1-GTF2A1L-201ENST00000394751 3534 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP332-201ENST00000391063 115 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP146-201ENST00000410743 123 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 BMS1P21-201ENST00000634565 365 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 AC123768.1-201ENST00000486285 432 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP446-201ENST00000515955 82 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 AC012409.1-201ENST00000560176 358 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 ASNSP1-201ENST00000518311 1939 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 MTTP-201ENST00000265517 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 ADGRL3-202ENST00000504896 4816 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 RPL35AP15-201ENST00000468042 339 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
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