Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
GDAP2Q9NXN4 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
GDAP2Q9NXN4 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
GDAP2Q9NXN4 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
GDAP2Q9NXN4 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
GDAP2Q9NXN4 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
GDAP2Q9NXN4 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
GDAP2Q9NXN4 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
GDAP2Q9NXN4 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
GDAP2Q9NXN4 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
GDAP2Q9NXN4 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
GDAP2Q9NXN4 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
GDAP2Q9NXN4 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
GDAP2Q9NXN4 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
GDAP2Q9NXN4 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
GDAP2Q9NXN4 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
GDAP2Q9NXN4 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
GDAP2Q9NXN4 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
GDAP2Q9NXN4 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
GDAP2Q9NXN4 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC1.86□□□□□ -2.11
GDAP2Q9NXN4 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
GDAP2Q9NXN4 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
GDAP2Q9NXN4 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
GDAP2Q9NXN4 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
GDAP2Q9NXN4 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
GDAP2Q9NXN4 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
GDAP2Q9NXN4 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
GDAP2Q9NXN4 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
GDAP2Q9NXN4 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
GDAP2Q9NXN4 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
GDAP2Q9NXN4 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GDAP2Q9NXN4 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GDAP2Q9NXN4 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GDAP2Q9NXN4 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GDAP2Q9NXN4 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GDAP2Q9NXN4 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
GDAP2Q9NXN4 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GDAP2Q9NXN4 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
GDAP2Q9NXN4 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GDAP2Q9NXN4 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
GDAP2Q9NXN4 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
GDAP2Q9NXN4 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
GDAP2Q9NXN4 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GDAP2Q9NXN4 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GDAP2Q9NXN4 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GDAP2Q9NXN4 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
GDAP2Q9NXN4 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
GDAP2Q9NXN4 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
GDAP2Q9NXN4 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GDAP2Q9NXN4 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GDAP2Q9NXN4 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC1.85□□□□□ -2.11
GDAP2Q9NXN4 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
GDAP2Q9NXN4 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
GDAP2Q9NXN4 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
GDAP2Q9NXN4 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
GDAP2Q9NXN4 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
GDAP2Q9NXN4 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC1.85□□□□□ -2.11
GDAP2Q9NXN4 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GDAP2Q9NXN4 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GDAP2Q9NXN4 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GDAP2Q9NXN4 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GDAP2Q9NXN4 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GDAP2Q9NXN4 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
GDAP2Q9NXN4 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
GDAP2Q9NXN4 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GDAP2Q9NXN4 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GDAP2Q9NXN4 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GDAP2Q9NXN4 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GDAP2Q9NXN4 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GDAP2Q9NXN4 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GDAP2Q9NXN4 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GDAP2Q9NXN4 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GDAP2Q9NXN4 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GDAP2Q9NXN4 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GDAP2Q9NXN4 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GDAP2Q9NXN4 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GDAP2Q9NXN4 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GDAP2Q9NXN4 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GDAP2Q9NXN4 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GDAP2Q9NXN4 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GDAP2Q9NXN4 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
GDAP2Q9NXN4 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GDAP2Q9NXN4 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
GDAP2Q9NXN4 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GDAP2Q9NXN4 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GDAP2Q9NXN4 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GDAP2Q9NXN4 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GDAP2Q9NXN4 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
GDAP2Q9NXN4 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
GDAP2Q9NXN4 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
GDAP2Q9NXN4 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
GDAP2Q9NXN4 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
GDAP2Q9NXN4 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GDAP2Q9NXN4 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GDAP2Q9NXN4 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GDAP2Q9NXN4 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GDAP2Q9NXN4 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC1.83□□□□□ -2.12
GDAP2Q9NXN4 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC1.83□□□□□ -2.12
GDAP2Q9NXN4 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GDAP2Q9NXN4 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
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