Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CIPCQ9C0C6 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CIPCQ9C0C6 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CIPCQ9C0C6 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
CIPCQ9C0C6 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CIPCQ9C0C6 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CIPCQ9C0C6 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CIPCQ9C0C6 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CIPCQ9C0C6 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CIPCQ9C0C6 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CIPCQ9C0C6 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CIPCQ9C0C6 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CIPCQ9C0C6 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CIPCQ9C0C6 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CIPCQ9C0C6 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CIPCQ9C0C6 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CIPCQ9C0C6 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CIPCQ9C0C6 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CIPCQ9C0C6 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CIPCQ9C0C6 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CIPCQ9C0C6 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CIPCQ9C0C6 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CIPCQ9C0C6 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CIPCQ9C0C6 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CIPCQ9C0C6 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CIPCQ9C0C6 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CIPCQ9C0C6 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CIPCQ9C0C6 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CIPCQ9C0C6 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CIPCQ9C0C6 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CIPCQ9C0C6 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CIPCQ9C0C6 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
CIPCQ9C0C6 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CIPCQ9C0C6 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CIPCQ9C0C6 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CIPCQ9C0C6 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CIPCQ9C0C6 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CIPCQ9C0C6 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CIPCQ9C0C6 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CIPCQ9C0C6 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CIPCQ9C0C6 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CIPCQ9C0C6 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CIPCQ9C0C6 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CIPCQ9C0C6 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CIPCQ9C0C6 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CIPCQ9C0C6 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CIPCQ9C0C6 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CIPCQ9C0C6 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CIPCQ9C0C6 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CIPCQ9C0C6 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
CIPCQ9C0C6 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CIPCQ9C0C6 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CIPCQ9C0C6 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CIPCQ9C0C6 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CIPCQ9C0C6 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CIPCQ9C0C6 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CIPCQ9C0C6 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
CIPCQ9C0C6 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CIPCQ9C0C6 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CIPCQ9C0C6 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CIPCQ9C0C6 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CIPCQ9C0C6 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CIPCQ9C0C6 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CIPCQ9C0C6 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CIPCQ9C0C6 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CIPCQ9C0C6 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CIPCQ9C0C6 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CIPCQ9C0C6 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CIPCQ9C0C6 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CIPCQ9C0C6 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
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CIPCQ9C0C6 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
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CIPCQ9C0C6 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CIPCQ9C0C6 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CIPCQ9C0C6 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CIPCQ9C0C6 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CIPCQ9C0C6 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CIPCQ9C0C6 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CIPCQ9C0C6 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CIPCQ9C0C6 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CIPCQ9C0C6 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CIPCQ9C0C6 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CIPCQ9C0C6 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CIPCQ9C0C6 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CIPCQ9C0C6 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CIPCQ9C0C6 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CIPCQ9C0C6 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CIPCQ9C0C6 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CIPCQ9C0C6 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CIPCQ9C0C6 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CIPCQ9C0C6 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CIPCQ9C0C6 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CIPCQ9C0C6 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
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