Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
GEN1Q17RS7 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
GEN1Q17RS7 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
GEN1Q17RS7 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
GEN1Q17RS7 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GEN1Q17RS7 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GEN1Q17RS7 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GEN1Q17RS7 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GEN1Q17RS7 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GEN1Q17RS7 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GEN1Q17RS7 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC3.16□□□□□ -1.9
GEN1Q17RS7 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GEN1Q17RS7 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GEN1Q17RS7 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GEN1Q17RS7 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GEN1Q17RS7 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GEN1Q17RS7 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GEN1Q17RS7 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GEN1Q17RS7 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GEN1Q17RS7 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
GEN1Q17RS7 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GEN1Q17RS7 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GEN1Q17RS7 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GEN1Q17RS7 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GEN1Q17RS7 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GEN1Q17RS7 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GEN1Q17RS7 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GEN1Q17RS7 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
GEN1Q17RS7 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GEN1Q17RS7 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GEN1Q17RS7 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
GEN1Q17RS7 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
GEN1Q17RS7 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
GEN1Q17RS7 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.9
GEN1Q17RS7 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
GEN1Q17RS7 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
GEN1Q17RS7 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.9
GEN1Q17RS7 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
GEN1Q17RS7 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
GEN1Q17RS7 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
GEN1Q17RS7 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
GEN1Q17RS7 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
GEN1Q17RS7 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
GEN1Q17RS7 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
GEN1Q17RS7 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
GEN1Q17RS7 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
GEN1Q17RS7 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
GEN1Q17RS7 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
GEN1Q17RS7 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
GEN1Q17RS7 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
GEN1Q17RS7 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
GEN1Q17RS7 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
GEN1Q17RS7 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
GEN1Q17RS7 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
GEN1Q17RS7 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
GEN1Q17RS7 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
GEN1Q17RS7 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
GEN1Q17RS7 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
GEN1Q17RS7 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
GEN1Q17RS7 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
GEN1Q17RS7 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
GEN1Q17RS7 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
GEN1Q17RS7 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
GEN1Q17RS7 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
GEN1Q17RS7 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
GEN1Q17RS7 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
GEN1Q17RS7 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
GEN1Q17RS7 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GEN1Q17RS7 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GEN1Q17RS7 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GEN1Q17RS7 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GEN1Q17RS7 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GEN1Q17RS7 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GEN1Q17RS7 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GEN1Q17RS7 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GEN1Q17RS7 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GEN1Q17RS7 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GEN1Q17RS7 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GEN1Q17RS7 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GEN1Q17RS7 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GEN1Q17RS7 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
GEN1Q17RS7 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GEN1Q17RS7 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GEN1Q17RS7 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GEN1Q17RS7 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
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GEN1Q17RS7 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GEN1Q17RS7 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GEN1Q17RS7 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GEN1Q17RS7 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GEN1Q17RS7 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GEN1Q17RS7 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GEN1Q17RS7 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GEN1Q17RS7 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GEN1Q17RS7 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GEN1Q17RS7 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GEN1Q17RS7 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GEN1Q17RS7 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
GEN1Q17RS7 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GEN1Q17RS7 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
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