Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB8

LONRF1, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 1, humanhuman

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Length 773 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF1Q17RB8 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
LONRF1Q17RB8 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LONRF1Q17RB8 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LONRF1Q17RB8 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LONRF1Q17RB8 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LONRF1Q17RB8 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LONRF1Q17RB8 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LONRF1Q17RB8 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
LONRF1Q17RB8 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
LONRF1Q17RB8 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
LONRF1Q17RB8 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
LONRF1Q17RB8 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
LONRF1Q17RB8 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
LONRF1Q17RB8 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
LONRF1Q17RB8 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
LONRF1Q17RB8 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LONRF1Q17RB8 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LONRF1Q17RB8 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LONRF1Q17RB8 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LONRF1Q17RB8 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LONRF1Q17RB8 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LONRF1Q17RB8 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
LONRF1Q17RB8 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LONRF1Q17RB8 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LONRF1Q17RB8 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LONRF1Q17RB8 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LONRF1Q17RB8 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
LONRF1Q17RB8 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
LONRF1Q17RB8 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
LONRF1Q17RB8 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
LONRF1Q17RB8 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
LONRF1Q17RB8 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
LONRF1Q17RB8 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LONRF1Q17RB8 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LONRF1Q17RB8 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LONRF1Q17RB8 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LONRF1Q17RB8 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LONRF1Q17RB8 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
LONRF1Q17RB8 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
LONRF1Q17RB8 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LONRF1Q17RB8 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LONRF1Q17RB8 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LONRF1Q17RB8 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LONRF1Q17RB8 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LONRF1Q17RB8 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LONRF1Q17RB8 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LONRF1Q17RB8 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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LONRF1Q17RB8 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LONRF1Q17RB8 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LONRF1Q17RB8 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LONRF1Q17RB8 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LONRF1Q17RB8 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LONRF1Q17RB8 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LONRF1Q17RB8 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LONRF1Q17RB8 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LONRF1Q17RB8 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LONRF1Q17RB8 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LONRF1Q17RB8 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
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LONRF1Q17RB8 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LONRF1Q17RB8 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LONRF1Q17RB8 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LONRF1Q17RB8 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LONRF1Q17RB8 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
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LONRF1Q17RB8 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LONRF1Q17RB8 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LONRF1Q17RB8 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LONRF1Q17RB8 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LONRF1Q17RB8 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LONRF1Q17RB8 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LONRF1Q17RB8 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LONRF1Q17RB8 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LONRF1Q17RB8 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LONRF1Q17RB8 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LONRF1Q17RB8 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
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LONRF1Q17RB8 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
LONRF1Q17RB8 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LONRF1Q17RB8 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LONRF1Q17RB8 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LONRF1Q17RB8 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
LONRF1Q17RB8 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LONRF1Q17RB8 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LONRF1Q17RB8 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LONRF1Q17RB8 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
LONRF1Q17RB8 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
LONRF1Q17RB8 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
LONRF1Q17RB8 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
LONRF1Q17RB8 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LONRF1Q17RB8 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
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