Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
E2F4Q16254 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
E2F4Q16254 AC087501.4-201ENST00000574460 235 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
E2F4Q16254 MIR4443-201ENST00000585052 53 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
E2F4Q16254 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
E2F4Q16254 AL160290.3-201ENST00000604869 165 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
E2F4Q16254 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
E2F4Q16254 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
E2F4Q16254 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
E2F4Q16254 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
E2F4Q16254 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
E2F4Q16254 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
E2F4Q16254 MFSD8-216ENST00000641147 4009 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
E2F4Q16254 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
E2F4Q16254 ARID2-205ENST00000444670 7316 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
E2F4Q16254 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
E2F4Q16254 PATJ-202ENST00000316485 3657 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
E2F4Q16254 MTTP-201ENST00000265517 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
E2F4Q16254 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
E2F4Q16254 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
E2F4Q16254 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
E2F4Q16254 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
E2F4Q16254 RNA5SP22-201ENST00000365393 109 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
E2F4Q16254 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
E2F4Q16254 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
E2F4Q16254 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
E2F4Q16254 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
E2F4Q16254 AC100770.1-201ENST00000532310 322 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
E2F4Q16254 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
E2F4Q16254 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
E2F4Q16254 ERICH3-AS1-202ENST00000612390 4874 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
E2F4Q16254 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
E2F4Q16254 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
E2F4Q16254 ADGRL3-215ENST00000512091 12636 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
E2F4Q16254 RIMS1-204ENST00000401910 3542 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
E2F4Q16254 OR10J1-203ENST00000642080 3503 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
E2F4Q16254 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
E2F4Q16254 CNOT10-206ENST00000454516 2760 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
E2F4Q16254 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
E2F4Q16254 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
E2F4Q16254 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC5□□□□□ -1.61
E2F4Q16254 MIR708-201ENST00000390708 88 ntBASIC5□□□□□ -1.61
E2F4Q16254 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
E2F4Q16254 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
E2F4Q16254 AC011753.3-201ENST00000443436 406 ntBASIC5□□□□□ -1.61
E2F4Q16254 RN7SL41P-201ENST00000476144 297 ntBASIC5□□□□□ -1.61
E2F4Q16254 VWA8P1-201ENST00000510889 176 ntBASIC5□□□□□ -1.61
E2F4Q16254 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC5□□□□□ -1.61
E2F4Q16254 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC5□□□□□ -1.61
E2F4Q16254 AC007527.1-201ENST00000535528 313 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
E2F4Q16254 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC5□□□□□ -1.61
E2F4Q16254 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC5□□□□□ -1.61
E2F4Q16254 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC5□□□□□ -1.61
E2F4Q16254 AC007546.2-201ENST00000623996 360 ntBASIC5□□□□□ -1.61
E2F4Q16254 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
E2F4Q16254 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
E2F4Q16254 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
E2F4Q16254 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
E2F4Q16254 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
E2F4Q16254 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
E2F4Q16254 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
E2F4Q16254 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
E2F4Q16254 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
E2F4Q16254 IGLV3-26-201ENST00000520756 302 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
E2F4Q16254 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
E2F4Q16254 AC091564.3-201ENST00000527398 429 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
E2F4Q16254 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
E2F4Q16254 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
E2F4Q16254 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
E2F4Q16254 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
E2F4Q16254 EIF2S1-202ENST00000466499 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
E2F4Q16254 BTAF1-204ENST00000544642 6938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
E2F4Q16254 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
E2F4Q16254 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
E2F4Q16254 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
E2F4Q16254 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
E2F4Q16254 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
E2F4Q16254 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
E2F4Q16254 AL133412.1-201ENST00000380194 2992 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
E2F4Q16254 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
E2F4Q16254 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
E2F4Q16254 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
E2F4Q16254 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
E2F4Q16254 RN7SL610P-201ENST00000463845 291 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
E2F4Q16254 AC093297.2-204ENST00000508945 295 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
E2F4Q16254 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
E2F4Q16254 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
E2F4Q16254 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
E2F4Q16254 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
E2F4Q16254 RPAP2-203ENST00000610020 16993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
E2F4Q16254 AL589745.1-201ENST00000421190 3336 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
E2F4Q16254 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
E2F4Q16254 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
E2F4Q16254 MEI4-201ENST00000602452 4800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
E2F4Q16254 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
E2F4Q16254 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
E2F4Q16254 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
E2F4Q16254 RAPH1-203ENST00000374493 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
E2F4Q16254 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
E2F4Q16254 RNA5SP513-201ENST00000364648 118 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
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