Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC1.79□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC1.79□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
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GPNMBQ14956 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
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GPNMBQ14956 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
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