Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
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