Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
IRF5Q13568 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
IRF5Q13568 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
IRF5Q13568 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
IRF5Q13568 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
IRF5Q13568 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
IRF5Q13568 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
IRF5Q13568 SPATA31D2P-201ENST00000429999 4388 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
IRF5Q13568 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
IRF5Q13568 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
IRF5Q13568 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
IRF5Q13568 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
IRF5Q13568 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
IRF5Q13568 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
IRF5Q13568 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
IRF5Q13568 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
IRF5Q13568 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
IRF5Q13568 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
IRF5Q13568 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
IRF5Q13568 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
IRF5Q13568 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
IRF5Q13568 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
IRF5Q13568 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
IRF5Q13568 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
IRF5Q13568 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
IRF5Q13568 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
IRF5Q13568 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
IRF5Q13568 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
IRF5Q13568 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
IRF5Q13568 LINC02459-201ENST00000551761 474 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
IRF5Q13568 AC025627.2-201ENST00000576220 160 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
IRF5Q13568 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
IRF5Q13568 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
IRF5Q13568 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
IRF5Q13568 DAZ4-206ENST00000449750 3271 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
IRF5Q13568 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
IRF5Q13568 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
IRF5Q13568 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
IRF5Q13568 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
IRF5Q13568 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
IRF5Q13568 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
IRF5Q13568 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
IRF5Q13568 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
IRF5Q13568 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
IRF5Q13568 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
IRF5Q13568 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
IRF5Q13568 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
IRF5Q13568 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
IRF5Q13568 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
IRF5Q13568 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
IRF5Q13568 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
IRF5Q13568 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
IRF5Q13568 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
IRF5Q13568 RNU7-143P-201ENST00000516781 65 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
IRF5Q13568 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
IRF5Q13568 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
IRF5Q13568 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
IRF5Q13568 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
IRF5Q13568 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
IRF5Q13568 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
IRF5Q13568 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
IRF5Q13568 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
IRF5Q13568 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
IRF5Q13568 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
IRF5Q13568 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
IRF5Q13568 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
IRF5Q13568 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
IRF5Q13568 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
IRF5Q13568 STON1-GTF2A1L-204ENST00000405008 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
IRF5Q13568 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
IRF5Q13568 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
IRF5Q13568 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
IRF5Q13568 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
IRF5Q13568 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
IRF5Q13568 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
IRF5Q13568 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
IRF5Q13568 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
IRF5Q13568 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
IRF5Q13568 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
IRF5Q13568 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
IRF5Q13568 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
IRF5Q13568 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
IRF5Q13568 RNA5SP179-201ENST00000517284 121 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
IRF5Q13568 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
IRF5Q13568 GNRHR2P1-201ENST00000555315 631 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
IRF5Q13568 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
IRF5Q13568 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
IRF5Q13568 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
IRF5Q13568 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
IRF5Q13568 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
IRF5Q13568 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
IRF5Q13568 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
IRF5Q13568 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
IRF5Q13568 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
IRF5Q13568 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
IRF5Q13568 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
IRF5Q13568 GHRL-209ENST00000446937 217 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
IRF5Q13568 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
IRF5Q13568 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
IRF5Q13568 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 164.7 ms