Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SF3B2Q13435 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SF3B2Q13435 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SF3B2Q13435 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SF3B2Q13435 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SF3B2Q13435 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SF3B2Q13435 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SF3B2Q13435 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SF3B2Q13435 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SF3B2Q13435 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SF3B2Q13435 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SF3B2Q13435 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SF3B2Q13435 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SF3B2Q13435 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SF3B2Q13435 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SF3B2Q13435 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SF3B2Q13435 TLR8-202ENST00000311912 3367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
SF3B2Q13435 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
SF3B2Q13435 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
SF3B2Q13435 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SF3B2Q13435 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SF3B2Q13435 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SF3B2Q13435 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SF3B2Q13435 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SF3B2Q13435 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SF3B2Q13435 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SF3B2Q13435 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SF3B2Q13435 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SF3B2Q13435 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SF3B2Q13435 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SF3B2Q13435 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SF3B2Q13435 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SF3B2Q13435 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SF3B2Q13435 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SF3B2Q13435 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SF3B2Q13435 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SF3B2Q13435 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SF3B2Q13435 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SF3B2Q13435 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SF3B2Q13435 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
SF3B2Q13435 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SF3B2Q13435 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SF3B2Q13435 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SF3B2Q13435 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SF3B2Q13435 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SF3B2Q13435 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
SF3B2Q13435 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SF3B2Q13435 MUC7-201ENST00000304887 2443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
SF3B2Q13435 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
SF3B2Q13435 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SF3B2Q13435 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SF3B2Q13435 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
SF3B2Q13435 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SF3B2Q13435 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SF3B2Q13435 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SF3B2Q13435 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SF3B2Q13435 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SF3B2Q13435 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SF3B2Q13435 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SF3B2Q13435 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SF3B2Q13435 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SF3B2Q13435 PARP8-211ENST00000505554 3825 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SF3B2Q13435 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SF3B2Q13435 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SF3B2Q13435 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SF3B2Q13435 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SF3B2Q13435 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SF3B2Q13435 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SF3B2Q13435 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SF3B2Q13435 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SF3B2Q13435 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SF3B2Q13435 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SF3B2Q13435 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SF3B2Q13435 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SF3B2Q13435 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
SF3B2Q13435 DST-201ENST00000244364 16742 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
SF3B2Q13435 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
SF3B2Q13435 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SF3B2Q13435 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SF3B2Q13435 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SF3B2Q13435 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SF3B2Q13435 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SF3B2Q13435 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SF3B2Q13435 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SF3B2Q13435 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SF3B2Q13435 HLFP1-201ENST00000402375 499 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SF3B2Q13435 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SF3B2Q13435 RN7SL93P-201ENST00000463035 293 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SF3B2Q13435 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SF3B2Q13435 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SF3B2Q13435 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SF3B2Q13435 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SF3B2Q13435 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
SF3B2Q13435 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
SF3B2Q13435 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SF3B2Q13435 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
SF3B2Q13435 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SF3B2Q13435 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SF3B2Q13435 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SF3B2Q13435 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
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