Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 MTCO2P16-201ENST00000436962 677 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 AC025811.1-201ENST00000604312 472 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 SNORD116-9-201ENST00000384000 95 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 SNORD116-3-201ENST00000384287 95 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 SNORD116-7-201ENST00000384404 95 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 SNORD116-5-201ENST00000384462 95 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC1.84□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
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