Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 SYT14-208ENST00000637265 13567 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 PARP8-211ENST00000505554 3825 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
DUSP4Q13115 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
DUSP4Q13115 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
DUSP4Q13115 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
DUSP4Q13115 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
DUSP4Q13115 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
DUSP4Q13115 RNU1-89P-201ENST00000384592 164 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
DUSP4Q13115 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
DUSP4Q13115 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
DUSP4Q13115 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
DUSP4Q13115 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
DUSP4Q13115 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
DUSP4Q13115 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
DUSP4Q13115 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
DUSP4Q13115 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
DUSP4Q13115 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
DUSP4Q13115 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
DUSP4Q13115 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
DUSP4Q13115 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
DUSP4Q13115 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
DUSP4Q13115 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
DUSP4Q13115 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
DUSP4Q13115 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
DUSP4Q13115 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
DUSP4Q13115 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
DUSP4Q13115 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
DUSP4Q13115 MAPK10-373ENST00000641983 6772 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
DUSP4Q13115 OTUD6B-AS1-201ENST00000522817 4275 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
DUSP4Q13115 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC3.71□□□□□ -1.82
DUSP4Q13115 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
DUSP4Q13115 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
DUSP4Q13115 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
DUSP4Q13115 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
DUSP4Q13115 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
DUSP4Q13115 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
DUSP4Q13115 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
DUSP4Q13115 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
DUSP4Q13115 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
DUSP4Q13115 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
DUSP4Q13115 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
DUSP4Q13115 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
DUSP4Q13115 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
DUSP4Q13115 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
DUSP4Q13115 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
DUSP4Q13115 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
DUSP4Q13115 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
DUSP4Q13115 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
DUSP4Q13115 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
DUSP4Q13115 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
DUSP4Q13115 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
DUSP4Q13115 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
DUSP4Q13115 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
DUSP4Q13115 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
DUSP4Q13115 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
DUSP4Q13115 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
DUSP4Q13115 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
DUSP4Q13115 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
DUSP4Q13115 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
DUSP4Q13115 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
DUSP4Q13115 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
DUSP4Q13115 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
DUSP4Q13115 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
DUSP4Q13115 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
DUSP4Q13115 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
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