Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
BNIP1Q12981 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
BNIP1Q12981 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
BNIP1Q12981 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
BNIP1Q12981 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
BNIP1Q12981 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
BNIP1Q12981 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
BNIP1Q12981 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
BNIP1Q12981 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
BNIP1Q12981 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC1.85□□□□□ -2.11
BNIP1Q12981 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
BNIP1Q12981 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
BNIP1Q12981 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
BNIP1Q12981 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
BNIP1Q12981 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
BNIP1Q12981 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
BNIP1Q12981 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
BNIP1Q12981 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
BNIP1Q12981 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
BNIP1Q12981 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
BNIP1Q12981 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
BNIP1Q12981 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
BNIP1Q12981 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
BNIP1Q12981 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
BNIP1Q12981 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
BNIP1Q12981 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
BNIP1Q12981 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
BNIP1Q12981 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
BNIP1Q12981 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
BNIP1Q12981 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
BNIP1Q12981 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
BNIP1Q12981 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
BNIP1Q12981 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
BNIP1Q12981 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
BNIP1Q12981 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
BNIP1Q12981 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
BNIP1Q12981 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
BNIP1Q12981 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
BNIP1Q12981 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
BNIP1Q12981 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
BNIP1Q12981 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
BNIP1Q12981 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
BNIP1Q12981 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
BNIP1Q12981 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
BNIP1Q12981 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
BNIP1Q12981 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
BNIP1Q12981 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
BNIP1Q12981 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
BNIP1Q12981 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
BNIP1Q12981 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
BNIP1Q12981 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
BNIP1Q12981 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
BNIP1Q12981 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
BNIP1Q12981 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
BNIP1Q12981 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
BNIP1Q12981 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
BNIP1Q12981 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
BNIP1Q12981 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
BNIP1Q12981 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
BNIP1Q12981 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
BNIP1Q12981 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
BNIP1Q12981 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
BNIP1Q12981 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
BNIP1Q12981 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
BNIP1Q12981 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
BNIP1Q12981 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
BNIP1Q12981 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
BNIP1Q12981 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
BNIP1Q12981 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
BNIP1Q12981 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
BNIP1Q12981 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
BNIP1Q12981 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
BNIP1Q12981 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
BNIP1Q12981 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
BNIP1Q12981 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
BNIP1Q12981 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
BNIP1Q12981 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
BNIP1Q12981 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
BNIP1Q12981 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
BNIP1Q12981 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
BNIP1Q12981 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
BNIP1Q12981 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
BNIP1Q12981 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
BNIP1Q12981 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
BNIP1Q12981 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
BNIP1Q12981 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
BNIP1Q12981 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC1.82□□□□□ -2.12
BNIP1Q12981 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
BNIP1Q12981 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
BNIP1Q12981 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
BNIP1Q12981 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
BNIP1Q12981 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
BNIP1Q12981 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
BNIP1Q12981 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
BNIP1Q12981 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
BNIP1Q12981 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
BNIP1Q12981 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
BNIP1Q12981 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
BNIP1Q12981 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
BNIP1Q12981 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
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