Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 TMEM67-202ENST00000409623 3255 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 AC024022.1-202ENST00000508911 394 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
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