Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI42

CPA4, Carboxypeptidase A4, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA4Q9UI42 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CPA4Q9UI42 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CPA4Q9UI42 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CPA4Q9UI42 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CPA4Q9UI42 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CPA4Q9UI42 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CPA4Q9UI42 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CPA4Q9UI42 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CPA4Q9UI42 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CPA4Q9UI42 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CPA4Q9UI42 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CPA4Q9UI42 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CPA4Q9UI42 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CPA4Q9UI42 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CPA4Q9UI42 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CPA4Q9UI42 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CPA4Q9UI42 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CPA4Q9UI42 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CPA4Q9UI42 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CPA4Q9UI42 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CPA4Q9UI42 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CPA4Q9UI42 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CPA4Q9UI42 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CPA4Q9UI42 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CPA4Q9UI42 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CPA4Q9UI42 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CPA4Q9UI42 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CPA4Q9UI42 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CPA4Q9UI42 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CPA4Q9UI42 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CPA4Q9UI42 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CPA4Q9UI42 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CPA4Q9UI42 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CPA4Q9UI42 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CPA4Q9UI42 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CPA4Q9UI42 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CPA4Q9UI42 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CPA4Q9UI42 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CPA4Q9UI42 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CPA4Q9UI42 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CPA4Q9UI42 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CPA4Q9UI42 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CPA4Q9UI42 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CPA4Q9UI42 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CPA4Q9UI42 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CPA4Q9UI42 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CPA4Q9UI42 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CPA4Q9UI42 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CPA4Q9UI42 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CPA4Q9UI42 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CPA4Q9UI42 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CPA4Q9UI42 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CPA4Q9UI42 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CPA4Q9UI42 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CPA4Q9UI42 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CPA4Q9UI42 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CPA4Q9UI42 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CPA4Q9UI42 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CPA4Q9UI42 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CPA4Q9UI42 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CPA4Q9UI42 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CPA4Q9UI42 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CPA4Q9UI42 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CPA4Q9UI42 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CPA4Q9UI42 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CPA4Q9UI42 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CPA4Q9UI42 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CPA4Q9UI42 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CPA4Q9UI42 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CPA4Q9UI42 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CPA4Q9UI42 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CPA4Q9UI42 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CPA4Q9UI42 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CPA4Q9UI42 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CPA4Q9UI42 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CPA4Q9UI42 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CPA4Q9UI42 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CPA4Q9UI42 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CPA4Q9UI42 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CPA4Q9UI42 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CPA4Q9UI42 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CPA4Q9UI42 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CPA4Q9UI42 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CPA4Q9UI42 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CPA4Q9UI42 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CPA4Q9UI42 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CPA4Q9UI42 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CPA4Q9UI42 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CPA4Q9UI42 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CPA4Q9UI42 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CPA4Q9UI42 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CPA4Q9UI42 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CPA4Q9UI42 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CPA4Q9UI42 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CPA4Q9UI42 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CPA4Q9UI42 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CPA4Q9UI42 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CPA4Q9UI42 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CPA4Q9UI42 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CPA4Q9UI42 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms