Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MLH3Q9UHC1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MLH3Q9UHC1 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MLH3Q9UHC1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MLH3Q9UHC1 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MLH3Q9UHC1 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MLH3Q9UHC1 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MLH3Q9UHC1 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MLH3Q9UHC1 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MLH3Q9UHC1 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MLH3Q9UHC1 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MLH3Q9UHC1 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MLH3Q9UHC1 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MLH3Q9UHC1 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MLH3Q9UHC1 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MLH3Q9UHC1 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MLH3Q9UHC1 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MLH3Q9UHC1 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MLH3Q9UHC1 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
MLH3Q9UHC1 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MLH3Q9UHC1 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MLH3Q9UHC1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MLH3Q9UHC1 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MLH3Q9UHC1 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MLH3Q9UHC1 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MLH3Q9UHC1 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MLH3Q9UHC1 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MLH3Q9UHC1 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MLH3Q9UHC1 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MLH3Q9UHC1 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MLH3Q9UHC1 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MLH3Q9UHC1 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MLH3Q9UHC1 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MLH3Q9UHC1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MLH3Q9UHC1 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MLH3Q9UHC1 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MLH3Q9UHC1 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MLH3Q9UHC1 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MLH3Q9UHC1 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MLH3Q9UHC1 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MLH3Q9UHC1 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MLH3Q9UHC1 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MLH3Q9UHC1 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MLH3Q9UHC1 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
MLH3Q9UHC1 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MLH3Q9UHC1 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MLH3Q9UHC1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MLH3Q9UHC1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MLH3Q9UHC1 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MLH3Q9UHC1 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MLH3Q9UHC1 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MLH3Q9UHC1 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MLH3Q9UHC1 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
MLH3Q9UHC1 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
MLH3Q9UHC1 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
MLH3Q9UHC1 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
MLH3Q9UHC1 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
MLH3Q9UHC1 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
MLH3Q9UHC1 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
MLH3Q9UHC1 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
MLH3Q9UHC1 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
MLH3Q9UHC1 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
MLH3Q9UHC1 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MLH3Q9UHC1 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MLH3Q9UHC1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MLH3Q9UHC1 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MLH3Q9UHC1 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MLH3Q9UHC1 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MLH3Q9UHC1 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MLH3Q9UHC1 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MLH3Q9UHC1 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MLH3Q9UHC1 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MLH3Q9UHC1 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MLH3Q9UHC1 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MLH3Q9UHC1 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MLH3Q9UHC1 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MLH3Q9UHC1 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MLH3Q9UHC1 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MLH3Q9UHC1 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MLH3Q9UHC1 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MLH3Q9UHC1 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MLH3Q9UHC1 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MLH3Q9UHC1 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MLH3Q9UHC1 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
MLH3Q9UHC1 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MLH3Q9UHC1 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MLH3Q9UHC1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MLH3Q9UHC1 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MLH3Q9UHC1 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MLH3Q9UHC1 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MLH3Q9UHC1 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
MLH3Q9UHC1 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MLH3Q9UHC1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MLH3Q9UHC1 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MLH3Q9UHC1 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
MLH3Q9UHC1 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MLH3Q9UHC1 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MLH3Q9UHC1 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MLH3Q9UHC1 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MLH3Q9UHC1 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms