Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms