Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY46

SCN3A, Sodium channel protein type 3 subunit alpha, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN3AQ9NY46 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCN3AQ9NY46 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SCN3AQ9NY46 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCN3AQ9NY46 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCN3AQ9NY46 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCN3AQ9NY46 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
SCN3AQ9NY46 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SCN3AQ9NY46 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
SCN3AQ9NY46 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SCN3AQ9NY46 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCN3AQ9NY46 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCN3AQ9NY46 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCN3AQ9NY46 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCN3AQ9NY46 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCN3AQ9NY46 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCN3AQ9NY46 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SCN3AQ9NY46 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SCN3AQ9NY46 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCN3AQ9NY46 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCN3AQ9NY46 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCN3AQ9NY46 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SCN3AQ9NY46 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCN3AQ9NY46 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCN3AQ9NY46 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCN3AQ9NY46 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCN3AQ9NY46 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCN3AQ9NY46 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCN3AQ9NY46 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCN3AQ9NY46 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCN3AQ9NY46 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCN3AQ9NY46 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCN3AQ9NY46 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCN3AQ9NY46 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SCN3AQ9NY46 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SCN3AQ9NY46 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCN3AQ9NY46 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCN3AQ9NY46 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCN3AQ9NY46 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCN3AQ9NY46 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCN3AQ9NY46 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCN3AQ9NY46 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCN3AQ9NY46 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCN3AQ9NY46 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCN3AQ9NY46 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCN3AQ9NY46 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCN3AQ9NY46 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCN3AQ9NY46 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SCN3AQ9NY46 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCN3AQ9NY46 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SCN3AQ9NY46 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCN3AQ9NY46 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCN3AQ9NY46 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCN3AQ9NY46 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCN3AQ9NY46 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCN3AQ9NY46 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCN3AQ9NY46 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCN3AQ9NY46 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCN3AQ9NY46 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCN3AQ9NY46 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCN3AQ9NY46 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCN3AQ9NY46 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCN3AQ9NY46 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCN3AQ9NY46 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCN3AQ9NY46 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCN3AQ9NY46 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCN3AQ9NY46 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCN3AQ9NY46 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCN3AQ9NY46 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCN3AQ9NY46 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCN3AQ9NY46 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCN3AQ9NY46 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCN3AQ9NY46 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCN3AQ9NY46 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCN3AQ9NY46 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCN3AQ9NY46 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCN3AQ9NY46 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCN3AQ9NY46 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCN3AQ9NY46 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCN3AQ9NY46 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCN3AQ9NY46 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCN3AQ9NY46 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SCN3AQ9NY46 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCN3AQ9NY46 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCN3AQ9NY46 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCN3AQ9NY46 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCN3AQ9NY46 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SCN3AQ9NY46 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCN3AQ9NY46 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCN3AQ9NY46 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCN3AQ9NY46 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCN3AQ9NY46 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCN3AQ9NY46 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCN3AQ9NY46 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SCN3AQ9NY46 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCN3AQ9NY46 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCN3AQ9NY46 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCN3AQ9NY46 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCN3AQ9NY46 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCN3AQ9NY46 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCN3AQ9NY46 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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