Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU53

GINM1, Glycoprotein integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINM1Q9NU53 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms