Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE4

GTPBP4, Nucleolar GTP-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP4Q9BZE4 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTPBP4Q9BZE4 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTPBP4Q9BZE4 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
GTPBP4Q9BZE4 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTPBP4Q9BZE4 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GTPBP4Q9BZE4 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GTPBP4Q9BZE4 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GTPBP4Q9BZE4 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
GTPBP4Q9BZE4 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GTPBP4Q9BZE4 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GTPBP4Q9BZE4 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GTPBP4Q9BZE4 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GTPBP4Q9BZE4 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GTPBP4Q9BZE4 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GTPBP4Q9BZE4 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GTPBP4Q9BZE4 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GTPBP4Q9BZE4 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GTPBP4Q9BZE4 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GTPBP4Q9BZE4 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GTPBP4Q9BZE4 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GTPBP4Q9BZE4 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GTPBP4Q9BZE4 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GTPBP4Q9BZE4 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GTPBP4Q9BZE4 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GTPBP4Q9BZE4 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GTPBP4Q9BZE4 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
GTPBP4Q9BZE4 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GTPBP4Q9BZE4 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GTPBP4Q9BZE4 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GTPBP4Q9BZE4 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GTPBP4Q9BZE4 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GTPBP4Q9BZE4 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GTPBP4Q9BZE4 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GTPBP4Q9BZE4 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GTPBP4Q9BZE4 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GTPBP4Q9BZE4 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GTPBP4Q9BZE4 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GTPBP4Q9BZE4 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GTPBP4Q9BZE4 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTPBP4Q9BZE4 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTPBP4Q9BZE4 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GTPBP4Q9BZE4 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GTPBP4Q9BZE4 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GTPBP4Q9BZE4 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GTPBP4Q9BZE4 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GTPBP4Q9BZE4 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GTPBP4Q9BZE4 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTPBP4Q9BZE4 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GTPBP4Q9BZE4 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTPBP4Q9BZE4 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTPBP4Q9BZE4 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GTPBP4Q9BZE4 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTPBP4Q9BZE4 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTPBP4Q9BZE4 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GTPBP4Q9BZE4 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTPBP4Q9BZE4 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTPBP4Q9BZE4 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTPBP4Q9BZE4 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTPBP4Q9BZE4 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTPBP4Q9BZE4 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTPBP4Q9BZE4 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTPBP4Q9BZE4 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTPBP4Q9BZE4 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTPBP4Q9BZE4 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GTPBP4Q9BZE4 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTPBP4Q9BZE4 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GTPBP4Q9BZE4 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTPBP4Q9BZE4 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTPBP4Q9BZE4 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTPBP4Q9BZE4 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTPBP4Q9BZE4 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GTPBP4Q9BZE4 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GTPBP4Q9BZE4 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GTPBP4Q9BZE4 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GTPBP4Q9BZE4 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GTPBP4Q9BZE4 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTPBP4Q9BZE4 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GTPBP4Q9BZE4 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GTPBP4Q9BZE4 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTPBP4Q9BZE4 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTPBP4Q9BZE4 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTPBP4Q9BZE4 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTPBP4Q9BZE4 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GTPBP4Q9BZE4 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTPBP4Q9BZE4 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTPBP4Q9BZE4 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GTPBP4Q9BZE4 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GTPBP4Q9BZE4 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTPBP4Q9BZE4 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GTPBP4Q9BZE4 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTPBP4Q9BZE4 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTPBP4Q9BZE4 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTPBP4Q9BZE4 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GTPBP4Q9BZE4 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTPBP4Q9BZE4 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GTPBP4Q9BZE4 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GTPBP4Q9BZE4 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTPBP4Q9BZE4 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
GTPBP4Q9BZE4 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GTPBP4Q9BZE4 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms